这是名为 TomoJ 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 TomoJ with OnWorks 的应用程序是免费的。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
托莫
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商品描述
TomoJ 是用于断层扫描重建的 ImageJ 插件。
它是为电子断层扫描而设计的,但是任何使用平行光束的采集都应该工作。
TomoJ 建议在 3D 重建(WBP、ART、SIRT、OS-SART、压缩感知)之前对倾斜系列进行预处理和配准。
TomoJ 是用 Java 编写的,计算是多线程的,并且可以在 CPU 或 GPU (OpenCL) 上执行重构。
注册描述在:
结构生物学杂志:X. 2020,第 4 卷。“电子断层扫描无标记图像对齐的改进”COS Sorzano 等人。 https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC 生物信息学。 2009 年 27 月 10 日;124:XNUMX。“电子断层扫描倾斜系列的无标记图像配准。” COS Sorzano 等。
重建部分描述于:
BMC 生物信息学。 2007 年 6 月 8 日;288:XNUMX。 “TomoJ:用于透射电子显微镜三维重建的断层扫描软件。”Messaoudi C 等
功能
- 断层摄影术
- 图像
- 倾斜系列对齐
- 3D重建
- 工作压力
- 艺术(ART)
- SIRT
- 压缩感测
用户界面
Java秋千
程式语言
Java、OpenCL
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/tomoj/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
