这是名为 Virmid 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Virmid-1.2.0.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Virmid with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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病毒
商品描述
新闻:
11-07-2013 新版本 Virmid 1.1.0 已上传。
08-29-2013 Virmid 论文现已发表在 Genome Biology 上。
Kim S 等人,“Virmid:通过样品杂质推断准确检测体细胞突变”,Genome Biology 2013,14:R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid(用于 SNP 调用的虚拟显微切割)是一种基于 Java 的变体调用器,专为疾病控制匹配样本而设计。 Virmid 还专门用于识别无法充分纯化疾病样本的个体污染中的潜力。 虽然 SNP 检出率受到这种异质性的严重影响,但 Virmid 可以通过考虑污染水平 (alpha) 来发现具有低等位基因频率的 SNP。 Virmid 的重要特点是:
• 估计(混合)疾病样本中对照样本的准确比例
•在估计比例方面改进了 SNP 和体细胞突变检出
特征
- 体细胞突变发现
- 样品杂质推断
目的
学术/科研
程式语言
爪哇岛
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/virmid/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。