这是名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation 的 Windows 应用程序，可在 Windows 在线运行于 Linux 在线，其最新版本可下载为 MCPerm_1.1.2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation 的应用程序，可通过 OnWorks 免费在线在 Windows 上运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
MCPerm：Monte Carlo SNP 置换可在 Windows 在线运行于 Linux 在线
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商品描述
MCPerm：病例对照关联研究中多重检验相关性的蒙特卡罗排列方法传统置换（TradPerm）检验是一种重要的非参数分析方法，可作为病例对照关联研究中多重检验校正的金标准。 然而，它依赖于原始的单核苷酸多态性（SNP）基因型和表型数据来执行大量随机洗牌，因此计算量大，特别是对于全基因组关联研究（GWAS）。 为了在不改变 TradPerm p 值大小的情况下提高计算速度，我们开发了一种蒙特卡罗排列 (MCPerm) 方法作为 TradPerm 的有效替代方法。
方法：MCPerm 不需要打乱原始基因型和表型数据。 它使用蒙特卡罗方法，采用两步超几何分布来生成病例和对照中基因型（AA、Aa 和 aa）的随机数。
程式语言
S / R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mcperm/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
