هذا هو الأمر asnval الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
asnval - التحقق من صحة سجلات التسلسل البيولوجي ASN.1
موجز
أسنفال [-] [-A] [-B] [-C N] [-D] [-E شارع] [-F] [-G] [-J] [-K] [-L اسم الملف] [-M]
[-N الأعلام] [-P N] [-Q N] [-R N] [-S N] [-T] [-U] [-X] [-Y] [-Z] [-a نوع] [-b] [-c]
[-d مسار] [-e] [-f شارع] [-i اسم الملف] [-k] [-l] [-o اسم الملف] [-p مسار] [-q] [-r] [-u]
[-v N] [-x شارع]
الوصف
أسنفال هي أداة سطر أوامر للتحقق من صحة سجلات التسلسل البيولوجي بتنسيق ASN.1.
OPTIONS
يتم تضمين ملخص من الخيارات أدناه.
- طباعة رسالة الاستخدام
-A تحقق من صحة التوافقات
-B تحقق من صحة الرموز الشريطية
-C N ماكس العد
-D تعطيل قمع الرسائل
-E شارع فقط رمز الخطأ للعرض
-F اختبار الوصول إلى الشبكة
-G بحث GI من الانضمام
-J هل تتطلب ISO-JTA؟
-K ملخص لملف الخطأ
-L اسم الملف
ملف السجل
-M قم بمطابقة locus_tag مع المعرف العام
-N الأعلام
خطوط الطول والعرض / أعلام الدولة
0 لا شيء
1 ولاية / مقاطعة اختبار
2 تجاهل استثناء الماء
3 - كلا ما سبق
-P N أعلى خطورة للخطأ الذي سيتم عرضه:
0 لا شيء
1 إعلامي
2 تحذير
3 خطأ (افتراضي لـ -Q)
4 أسباب للرفض (الافتراضي لـ -P, -R)
-Q N أقل شدة لظهور الخطأ ، لكل P
-R N شدة الخطأ في كود الإرجاع ، لكل P
-S N تخطي العد
-T استخدم الخيوط
-U تقديم مركز الجينوم
-X فحص لصق إكسون
-Y تحقق من المعرفات القديمة
-Z جلب منتج CDS عن بعد
-a نوع
نوع الإدخال ASN.1:
a تلقائي (افتراضي)
(ج) كاتيناتيد
ض أي
eq-Entry
ب بيوزك
مجموعة bioseq
م التسلسل الفرعي
ر baTch bioseq-set
u تسلسل الإرسال
-b الملف الدفعي هو ثنائي
-c الملف الدفعي مضغوط
-d مسار
المسار إلى بيانات ASN.1 الثنائية المفهرسة
-e تجاهل استثناءات النسخ / الترجمة
-x شارع مرشح السلسلة الفرعية
-i اسم الملف
ملف إدخال فردي (إدخال قياسي افتراضيًا)
-k الجلب المحلي
-l قفل المكونات مقدما
-o اسم الملف
ملف الإخراج الفردي
-p مسار
المسار إلى ملفات ASN.1
-q بحث التصنيف
-r الجلب عن بعد من المعرف
-u يعيد تنفيذ
-v N الإسهاب:
1 تقرير قياسي (افتراضي)
2 الانضمام/الخطورة/الكود (محدد بمسافة)
3 الانضمام / الخطورة / الكود (محدد بعلامات جدولة)
4 تقرير XML
5 الانضمام / المؤشر الجلايسيمي / الخطورة / الكود (محدد بعلامات جدولة)
-x شارع سلسلة فرعية لاختيار الملف (.ent بشكل افتراضي)
استخدم asnval عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
