هذا هو الأمر bp_sreformatp الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
bpsreformat - تحويل تنسيقات التسلسل
الوصف
يستخدم هذا البرنامج النصي نظام SeqIO الذي يسمح بتحويل تنسيقات التسلسل أيضًا
بيانات التسلسل أو بيانات محاذاة التسلسل المتعدد. الاسم يأتي من حقيقة أن شون
برنامج Eddy sreformat (جزء من HMMER pkg) يقوم بهذا بالفعل. يحاول برنامج شون
لتخمين تنسيقات الإدخال أثناء وجودنا في الكود ، نطلب منك حاليًا تحديد تنسيق
تكون تنسيقات الإدخال والإخراج وما إذا كانت البيانات من محاذاة تسلسل متعدد أو من
ملفات تسلسل مستقيم.
الاستخدام:
bpsreformat-if INFORMAT-of OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h / - تعليمات طباعة هذه التعليمات
-if / - informat تحديد تنسيق الإدخال
-of / - outformat تحديد تنسيق الإخراج
-i / - input حدد اسم ملف الإدخال
(لتمرير البيانات على STDIN ، استخدم علامة ناقص كاسم ملف)
-o / - output حدد اسم ملف الإخراج
(لتمرير البيانات على STDOUT ، استخدم علامة الطرح كاسم ملف)
--msa حدد هذه بيانات محاذاة متعددة التسلسل
- خاص سوف يمرر المعلمات الخاصة إلى AlignIO / SeqIO
الكائن - معظمها مخصص لكائنات Bio :: AlignIO
قائمة مفصولة بفواصل مما يلي
nointerleaved - لتنسيق phylip ، غير معشق
idlinebreak - بالنسبة لـ phylip ، يجعله تنسيق molphy
النسب المئوية - بالنسبة إلى clustalw ، أظهر٪ id لكل سطر
استخدم bp_sreformatp عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
