هذا هو الأمر demux الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
demux - تحويل قيود المسافة XPLOR إلى تنسيق Gromacs
موجز
demux md0.log احتفل على
الوصف
إذا كنت ترغب في جعل مساراتك مستمرة مرة أخرى، يمكنك استخدامها demux لقراءة
ملف md0.log الخاص بك (يمكنك ربط عدة ملفات إذا لزم الأمر) وإنتاج عدد قليل من المخرجات
ملفات. أحد هذه الملفات هو ملف .xvg (Replica_ndx.xvg) التي يمكن تمريرها إلى trjcat1 على طول
مع ملفات المسار الأصلية، من أجل إنتاج مسارات مستمرة. الأخرى
ملف (Replica_temp.xvg) يحتوي على درجات الحرارة لكل نسخة متماثلة، بدءًا من
درجة الحرارة الأصلية. لذا، إذا كانت النسخة المتماثلة التي تهمك تبدأ من 300 ألف، على سبيل المثال، فيمكنك المتابعة
مسارها من خلال الفضاء درجة الحرارة. سيكون من المثير للاهتمام إضافة بعض
وظيفة عمل رسوم بيانية لتوزيعات درجة الحرارة لكل نسخة متماثلة
وفقا لمعظم المؤلفين، يجب أن تكون مسطحة. يمكن استخدام المسارات المخففة مع
g_kinetics1 للحصول على حركية طي البروتين من مسارات REMD.
OPTIONS
md0.log ملف السجل الخاص بالمسار الذي ترغب في جعله مستمرًا. يمكن أن تكون ملفات متعددة
ملحقة معا.
احتفل على عدد المرات التي سيتم فيها نسخ كل إدخال في ملف السجل. (عدد صحيح)
القيود
إذا كان التبادل الخاص بك هو كل N ps وقمت بحفظ كل M ps يمكنك إجراؤه للمفقود
الإطارات عن طريق الإعداد احتفل على إلى (N/M - 1). إذا لم يكن N/M عددًا صحيحًا، فلن يحالفك الحظ
لن تكون قادرة على demux المسارات الخاصة بك على الإطلاق.
استخدم demux عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
