هذا هو الأمر epestfinde الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
epestfind - البحث عن أشكال PEST كمواقع انقسام محتملة للبروتين
موجز
com.epestfind -تسلسل تسلسل [- بيانات ملف البيانات] -نافذة او شباك عدد صحيح -ترتيب اختيار
[-عتبة الطفو] -كثرة الوحيدات منطقية -محتمل منطقية -مسكين منطقية
-غير صالح منطقية -خريطة منطقية -ملف ملف -رسم بياني xygraph
com.epestfind -مساعدة
الوصف
com.epestfind هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) قيادة "البروتين: الدوافع".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل تسلسل
تسلسل البروتين في الولايات المتحدة الأمريكية ليتم تحليله.
- بيانات ملف البيانات
القيمة الافتراضية: Emolwt.dat
مطلوب: قسم
-نافذة او شباك عدد صحيح
أدنى مسافة بين الأحماض الأمينية موجبة الشحنة. القيمة الافتراضية: 10
-ترتيب اختيار
اسم ملف الإخراج الذي يحتوي على نتائج التحليل. يمكن فرز النتائج
حسب الطول والموقع والنتيجة. القيمة الافتراضية: النتيجة
إضافي قسم
-عتبة الطفو
قيمة الحد للتمييز بين الأشكال الضعيفة من PEST المحتملة. زخارف PEST الصالحة هي
يتم التمييز بين الأشكال "الفقيرة" و "المحتملة" اعتمادًا على درجة العتبة هذه. بواسطة
افتراضيًا ، يتم تعيين القيمة الافتراضية على +5.0 بناءً على البيانات التجريبية. التعديلات
لا ينصح به لأن الأهمية هي مسألة بيولوجيا وليست رياضيات. تقصير
القيمة: +5.0
متقدم قسم
-كثرة الوحيدات منطقية
القيمة الافتراضية: N
-محتمل منطقية
قرر ما إذا كان يجب طباعة أشكال PEST المحتملة. القيمة الافتراضية: ص
-مسكين منطقية
قرر ما إذا كان يجب طباعة أشكال PEST السيئة. القيمة الافتراضية: ص
-غير صالح منطقية
قرر ما إذا كان يجب طباعة نماذج PEST غير الصالحة. القيمة الافتراضية: N
-خريطة منطقية
قرر ما إذا كان يجب تعيين أشكال PEST للتسلسل. القيمة الافتراضية: ص
الناتج قسم
-ملف ملف
اسم الملف الذي ستكتب النتائج إليه.
-رسم بياني xygraph
استخدم epestfinde عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
