هذا هو الأمر gt-eval الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gt-eval - مقارنة ملفات التعليقات التوضيحية وإظهار مقاييس الدقة (التنبؤ مقابل المرجع).
موجز
gt وحدة التقييم مرجع_ملف التنبؤ_ملف
الوصف
- نو [نعم | لا]
تقييم مستوى النوكليوتيدات (يتناسب استهلاك الذاكرة مع أحجام ملفات الإدخال)
(الافتراضي: نعم)
-لتر [نعم | لا]
قم بتقييم تنبؤ إعادة النقل LTR بدلاً من التنبؤ الجيني (الكل
تعتبر عناصر LTR_retrotransposon ذات خيط غير محدد) (الافتراضي:
لا)
-ltrdelta [قيمنا]
تعيين الدلتا المسموح بها لحدود LTR ليتم اعتبارها متساوية (الافتراضي: 20)
-v [نعم | لا]
تكون مطولة (الافتراضي: لا)
-o [اسم الملف]
إعادة توجيه الإخراج إلى ملف محدد (الافتراضي: غير محدد)
-gzip [نعم | لا]
كتابة ملف الإخراج المضغوط gzip (الافتراضي: لا)
-bzip2 [نعم | لا]
كتابة ملف إخراج مضغوط bzip2 (الافتراضي: لا)
-فرض [نعم | لا]
فرض الكتابة إلى ملف الإخراج (الافتراضي: لا)
-مساعدة
عرض المساعدة والخروج
-الإصدار
عرض معلومات الإصدار والخروج
يعرض البرنامج قيم الحساسية والخصوصية لأنواع معينة من الميزات (على سبيل المثال،
الجينات، مرنا، وإكسون). بالنسبة لبعض أنواع الميزات، عدد الميزات المفقودة والخاطئة
ويظهر هذا النوع أيضًا. وبالتالي فإن كلمة "مفقود" تعني عدد الميزات من هذا النوع
"المرجع" دون تداخل مع ميزة من هذا النوع من "التنبؤ". نائب
وعلى العكس من ذلك، فإن "الخطأ" يدل على عدد ميزات ذلك النوع من "التنبؤ" بدونه
تتداخل مع ميزة من هذا النوع من "المرجع".
التبليغ بق
إبلاغ عن الأخطاء إلى[البريد الإلكتروني محمي]>.
استخدم gt-eval عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
