الخمير - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

الخمير - العد k-mer، والتصفية واجتياز الرسم البياني FTW!

الخمير عبارة عن مكتبة ومجموعة أدوات لإجراء تحليل وتحويلات مجموعة البيانات المستندة إلى k-mer

موجز

الخمير [خيارات] وسائط

على سبيل المثال.

الخمير تحميل في العد -x 1e8 -k 20 reads.ct reads.fa.gz

الاستعمال

تصف هذه الصفحة فقط الخمير البرنامج النصي المجمع. للتعرف على البرامج و
كيفية استخدامه يرجى الاطلاع على /usr/share/doc/khmer أو غير ذلك http://khmer.readthedocs.org/.

في نظام Debian/Ubuntu، يتجنب مشرفو الحزم وضع مجموعات كبيرة من البرامج النصية مباشرةً
في PATH النظام. بدلاً من ذلك، يتم استخدام برنامج نصي مجمع واحد لتشغيل البرنامج النصي لك
تريد استخدامها؛ لذلك إذا كانت تعليمات الخمير تقول بالتشغيل تحميل في counting.py
...أيا كان... تحتاج إلى بادئة هذا الأمر بـ الخمير. علاوة على ذلك، فإن الامتداد .py
قد يتم حذفها، مما يؤدي إلى إصدار أمر بالتنسيق الموضح أعلاه.

إذا لم يعجبك هذا، فما عليك سوى إضافة /usr/lib/khmer/bin إلى المسار الشخصي الخاص بك.

استخدم لغة الخمير عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net