هذا هو الأمر masai_output_se الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
masai_output_se - إخراج Masai - وضع طرف واحد
موجز
masai_output_se [الخيارات]
الوصف
Masai هو مخطط قراءة سريع ودقيق يعتمد على بذور تقريبية ومتعددة
التراجع.
يرى http://www.seqan.de/projects/masai للمزيد من المعلومات.
(ج) حقوق الطبع والنشر 2011-2012 بواسطة Enrico Siragusa.
-h, --مساعدة
يعرض رسالة المساعدة هذه.
--الإصدار
عرض معلومات الإصدار
خيارات التعيين:
-ng, - لا فجوات
لا تحاذي القراءات مع الفجوات.
-m, --اعواد الكبريت NUM
الحد الأقصى لعدد المطابقات لكل قراءة.
خيارات الإخراج:
-t, - مجلد tmp STR
حدد مجلدًا مؤقتًا ضخمًا. الافتراضي: استخدم مجلد الجينوم.
-o, --ملف إلاخراج FILE
حدد ملف الإخراج. الافتراضي: استخدم بادئة اسم الملف reads. أنواع الملفات الصالحة
هي: خام وسام.
-NC, - لا سيجار
لا تقم بإخراج سلسلة CIGAR. هذا يؤثر فقط على إخراج SAM.
خيارات التصحيح:
-اختصار الثاني, --لا تفريغ
لا تفريغ النتائج.
VERSION
إصدار masai_output_se: 0.7.1 [14053] آخر تحديث 2013-05-16
استخدم masai_output_se عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net