هذا هو الأمر med2ris الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
med2ris - تحويل البيانات الببليوغرافية Medline / Pubmed إلى تنسيق RIS
موجز
med2ris [-ه logdest] [-F من بين الترميز] [-ح] [-i] [-l مستوى السجل] [-ل ملف تسجيل] [-O ملف]
[-O ملف] [-ف] [-ر إلى الترميز] [-ت نوع] [-ذ مسار]
الوصف
يقوم med2ris بتحويل البيانات المرجعية المنشورة إلى بيانات RIS. يفهم المحول كلا من
تنسيق Pubmed الموسوم (والذي يشبه بشكل سطحي RIS) وتنسيق XML وفقًا لـ
ال مقالة PubMed DTD[1]. في معظم الحالات يكون med2ris قادرًا على اكتشاف الإدخال تلقائيًا
نوع البيانات.
OPTIONS
-e وجهة الدخول
يمكن أن تحتوي وجهة السجل على القيم 0 أو 1 أو 2 أو السلاسل المكافئة ستدير,
سيسلوغالطرق أو ملف، على التوالى. تحدد هذه القيمة المكان الذي تنتقل إليه معلومات السجل.
0 (صفر) يعني أنه تم إرسال الرسائل إلى stderr. وهي متوفرة على الفور على
الشاشة لكنها قد تتداخل مع إخراج الأمر. 1 سيرسل الإخراج إلى
مرفق سجل النظام. ضع في اعتبارك أنه يجب تكوين سجل النظام لقبول رسائل السجل
من برامج المستخدم ، راجع سيسلوغ(8) دليل لمزيد من المعلومات. يونكس مثل
عادةً ما تحفظ الأنظمة هذه الرسائل في /var/log/user.log. 2 سيرسل الرسائل إلى
ملف سجل مخصص يمكن تحديده بامتداد -L الخيار.
-f من بين الترميز
حدد ترميز أحرف الإدخال. تعتمد الترميزات المدعومة على النظام الأساسي و
يمكن عادة العثور عليها في iconv_open(3). إذا لم يتم تحديد أي ترميزات ، ISO-8859-1 يعرف أيضا باسم
يفترض اللاتينية -1.
-h
يعرض شاشة التعليمات والاستخدام ، ثم يخرج.
-i
قم بإخراج معلومات إضافية حول العلامات غير المعروفة أو غير المستخدمة. من المفيد بشكل أساسي تصحيح أخطاء
التحويل إذا تغير تنسيق الإدخال.
-l تسجيل مستوى
حدد الأولوية التي يتم تسجيل الأحداث لها. هذا إما رقم يقع بين 0
و 7 أو أحد الأوتار EMERG, إنذار, Crit, أخطأ, تحذير, إشعار, info, تصحيح,
على التوالي (انظر أيضًا تعريفات مستوى السجل). -1 تعطيل التسجيل تماما. منخفض
مستوى السجل مثل 0 يعني أنه يتم تسجيل الرسائل الأكثر أهمية فقط. سجل أعلى
المستوى يعني أنه يتم تسجيل الأحداث الأقل خطورة أيضًا. 7 سيتضمن التصحيح
رسائل. يمكن أن يكون الأخير مطولًا وفيرًا ، لذلك تريد تجنب مستوى السجل هذا
إلا إذا كنت بحاجة لتعقب المشاكل.
-L ملف تسجيل
حدد المسار الكامل لملف السجل الذي سيتلقى رسائل السجل. عادة هذا
سيكون / var / log / refdba.
-o ملف
إرسال الإخراج إلى ملف. إذا ملف موجود ، سيتم الكتابة فوق محتوياته.
-O ملف
إرسال الإخراج إلى ملف. إذا ملف موجود ، سيتم إلحاق الإخراج.
-q
ابدأ بدون قراءة ملفات التكوين. سيستخدم العميل وقت الترجمة
القيم الافتراضية لجميع القيم التي لم تقم بتعيينها باستخدام مفاتيح التبديل الموجودة بسطر الأوامر.
-t إلى الترميز
حدد ترميز أحرف الإخراج. تعتمد الترميزات المدعومة على النظام الأساسي و
يمكن عادة العثور عليها في iconv_open(3). إذا لم يتم تحديد أي ترميزات ، ISO-8859-1 يعرف أيضا باسم
يفترض اللاتينية -1.
-T نوع
يتجاوز الاكتشاف التلقائي للنوع. القيم المسموح بها ل نوع هما "العلامة" و"xml"
لتنسيق Pubmed الموسوم وتنسيق XML Pubmed، على التوالي.
-y Confdir
حدد الدليل حيث تكون ملفات التكوين العامة ملاحظة: بشكل افتراضي ، الكل
تبحث تطبيقات RefDB عن ملفات التكوين الخاصة بها في الدليل المحدد
أثناء خطوة التكوين عند إنشاء الحزمة. هذا يعني أنك لست بحاجة إلى ملف -y
الخيار ما لم تستخدم ثنائيات مجمعة مسبقًا في مواقع غير معتادة ، على سبيل المثال عن طريق نقل ملف
حزمة rpm.
CONFIGURATION
med2ris بتقييم الملف med2risrc لتهيئة نفسه.
طاولات ومكاتب 1. med2risrc
┌──────────┬──────────────────────┬─────────────── ───────────┐
│متغير │ الترتيب │ الرسالة │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│ ملف (بلا) │ ملف الإخراج الافتراضي │
│ │ │ الاسم. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│لحق │ t يحدد ما إذا كان │
│ │ │ يتم إلحاق الإخراج (t) │
│ │ │ إلى ملف موجود أو │
│ │ │ بالكتابة فوق (f) و │
│ │ │ الملف الموجود. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│ غير مخطط │ t │ إذا تم الضبط على t، غير معروف │
│ │ │ العلامات في بيانات الإدخال │
│ │ │ سيتم إخراجها بعد │
│ │ │ أ بطاقة شعار؛ │
يمكن أن تكون البيانات الناتجة │ │ │ │
│ │ │ تفتيشها ومن ثم يتم │
│ │ │ أرسلت من خلال عطش إلى │
│ │ │ خلع هذه │
│ │ │ خطوط إضافية. إذا تم تعيين │
│ │ │ إلى f، سوف علامات غير معروفة │
│ │ │ بأمانة تجاهلها. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│ من_enc │ ISO-8859-1 ترميز الأحرف
│ │ │ من بيانات الإدخال │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│to_enc │ ISO-8859-1 │ ترميز الأحرف │
│ │ │ من بيانات الإخراج │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│logfile │ /var/log/med2ris.log المسار الكامل لـ │
│ │ │ ملف سجل مخصص. هذا شكل │
│ │ │ تستخدم فقط إذا كان logdest هو │
│ │ │ تعيين بشكل مناسب. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│logdest │ 1 وجهة │
│ │ │ معلومات السجل. 0 = │
│ │ │ طباعة إلى ستدير ؛ 1 = استخدم │
│ │ │ مرفق سجل النظام ؛ 2 = │
│ │ │ استخدام ملف سجل مخصص. │
│ │ │ هذا الأخير يحتاج إلى │
│ │ │ الإعداد المناسب لـ │
│ │ │ ملف السجل. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│loglevel │ 6 │ مستوى السجل يصل إلى │
│ │ │ الرسائل التي ستكون │
│ │ │ أرسلت. إعداد منخفض (0) │
│ │ │ يسمح فقط بمعظم │
│ │ │ رسائل مهمة ا │
│ │ │ الإعداد العالي (7) يسمح │
│ │ │ جميع الرسائل بما في ذلك │
│ │ │ رسائل التصحيح. -1 يعني │
│ │ │ لن يتم تسجيل أي شيء. │
└──────────┴──────────────────────┴─────────────── ───────────┘
بيانات معالجة
يتم تقسيم الكلمات الرئيسية ذات العناوين الفرعية المتعددة لـ MeSH إلى كلمات رئيسية متعددة باستخدام MeSH واحد
كل عنوان فرعي. هذا يبسط البحث عن العناوين الفرعية في MeSH بشكل كبير.
med2ris لا يتحقق من صحة ملفات الإدخال. وهذا يعني أن ملفات الإدخال يجب أن تلتزم بامتداد
قواعد مصادر البيانات، وإلا فإن نتائج التحويل لا يمكن التنبؤ بها.
استخدم med2ris عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
