هذا هو أمر QualityScores الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
نقاط الجودة - أحد مكونات مجموعة القراءة الفرعية
الاستعمال
نقاط الجودة [خيارات] -i -o
الحجج المطلوبة:
-i
اسم ملف الإدخال بما في ذلك بيانات القراءة. التنسيق الافتراضي هو Fastq.
-o
اسم ملف الإخراج وهو ملف نصي يتضمن درجات Phred لكل قاعدة قراءة.
وسيطات اختيارية:
--gzFASTQinput ملف الإدخال بتنسيق Fastq gzipped.
--مدخل
ملف الإدخال بتنسيق BAM.
--SAM الإدخال
ملف الإدخال بتنسيق SAM.
--النهاية الأولى
استخدم القراءات الأولى فقط في البيانات المقترنة. ينطبق فقط على BAM/SAM المزدوج
إدخال.
--النهاية الثانية
استخدم القراءات الثانية فقط في البيانات المقترنة. ينطبق فقط على BAM/SAM المزدوج
إدخال.
--عد القراءات إجمالي عدد القراءات التي سيتم استخراجها من الإدخال
ملف. 10,000 افتراضيا.
--phred-إزاحة <33|64> يشير إلى مصفف القراءة الفرعية.
استخدم نقاط الجودة عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
