xml2dsr - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

؛ xml2dsr - تحويل ملف DICOM SR ومجموعة البيانات إلى XML

موجز

xml2dsr [خيارات] xmlfile-in dsrfile-out

الوصف

• xml2dsr تقوم الأداة المساعدة بتحويل محتويات مستند XML (لغة التوصيف الموسعة)
إلى تنسيق DICOM Structured Reporting (SR) (تنسيق ملف أو مجموعة بيانات أولية). مخطط XML
dsr2xml.xsd لا يتبع أي تنسيق قياسي حتى الآن. ومع ذلك ، فإن xml2dsr استمارتنا
يمكن تعزيز هذا الجانب في المستقبل (على سبيل المثال من خلال دعم HL7/CDA - Clinical
هندسة الوثيقة).

يمكن إنشاء ملف XML مناسب باستخدام امتداد dsr2xml أداة (خيار + Xn أوصى
إضافة إعلان مساحة اسم XML إلى العنصر الجذر).

المعلمات

xmlfile-in XML سيتم تحويل اسم ملف الإدخال (stdin: "-")

dsrfile-out اسم ملف الإخراج DICOM SR

OPTIONS

جنرال لواء الخيارات
ح- مساعدة
اطبع نص المساعدة واخرج

--الإصدار
طباعة معلومات الإصدار والخروج

--الحجج
طباعة وسيطات سطر الأوامر الموسعة

-Q - هادئ
الوضع الصامت ، لا تطبع أي تحذيرات وأخطاء

-v - الإسراف
الوضع المطول ، تفاصيل معالجة الطباعة

-د - ديبوغ
وضع التصحيح ، طباعة معلومات التصحيح

-ll --log-level [l] evel: سلسلة ثابتة
(فادح ، خطأ ، تحذير ، معلومات ، تصحيح ، تتبع)
استخدام المستوى l للمسجل

-lc --log-config [f] ilename: string
استخدام ملف التكوين f للمسجل

إدخال الخيارات
التشفير:

+ Ee - غلاف القالب
يحتوي عنصر القالب على عناصر المحتوى

معالجة الخيارات
تصديق:

+ Vs - التحقق من صحة المخطط
التحقق من صحة مستند XML مقابل المخطط
(ليس مع - قالب - مغلف)

# يتطلب ترجمة libxml مع دعم مخطط XML

+ Vn - تحقق من مساحة الاسم
تحقق من مساحة اسم XML في جذر المستند

المعرفات الفريدة:

+ Ug - إنشاء موائع جديدة
إنشاء UID مثيل جديد للدراسة / السلسلة / SOP

-Uo - لا تستبدل - uids
لا تكتب فوق معرّفات UID الموجودة (افتراضي)

+ Uo - الكتابة فوق uids
الكتابة فوق UIDs الموجودة

الناتج الخيارات
تنسيق ملف الإخراج:

+ F - كتابة ملف
تنسيق ملف الكتابة (افتراضي)

-F - كتابة- مجموعة البيانات
كتابة مجموعة البيانات بدون معلومات ملف التعريف

بناء جملة نقل الإخراج:

+ t = - اكتب xfer نفس
الكتابة بنفس TS كإدخال (افتراضي)

+ te - اكتب xfer القليل
اكتب باستخدام VR الصغير Endian TS

+ tb - اكتب xfer-big
اكتب باستخدام VR الكبير Endian TS

+ ti - اكتب xfer ضمنيًا
الكتابة مع الواقع الافتراضي قليلا Endian TS

+ td - اكتب xfer-deflated
الكتابة مع صريحة فرغ من الهواء قليلا endian TS

تمثيلات القيمة بعد عام 1993:

+ u --enable-new-vr
تمكين دعم VRs الجديدة (UN / UT) (افتراضي)

-u - تعطيل جديد- vr
تعطيل دعم VRs الجديدة ، والتحويل إلى OB

ترميز طول المجموعة:

+ g = - إعادة حساب طول المجموعة
إعادة حساب أطوال المجموعة إذا كانت موجودة (افتراضي)

+ ز - مجموعة الطول - إنشاء
اكتب دائمًا باستخدام عناصر طول المجموعة

-g - مجموعة-طول-إزالة
اكتب دائمًا بدون عناصر طول المجموعة

ترميز الطول بالتسلسل والعناصر:

+ ه - الطول الصريح
الكتابة بأطوال صريحة (افتراضي)

-E - الطول - غير محدد
اكتب بأطوال غير محددة

المساحة المتروكة لمجموعة البيانات (ليس باستخدام مجموعة بيانات الكتابة):

-p = - الحشوة-الاحتفاظ
لا تغير المساحة المتروكة (الافتراضي إن لم يكن - اكتب مجموعة البيانات)

-p - الوسادة
بلا حشوة (ضمنيًا إذا - اكتب مجموعة البيانات)

+ p - padding-create [f] ile-pad [i] tem-pad: عدد صحيح
محاذاة الملف على مضاعفات f بايت
وعناصر في مضاعفات i بايت

انكماش مستوى الضغط (فقط مع --write-xfer-deflated):

+ cl - مستوى الضغط [l] evel: عدد صحيح (افتراضي: 6)
0 = غير مضغوط ، 1 = أسرع ، 9 = أفضل ضغط

الملاحظات

ديكوم التوافق
• xml2dsr تدعم الأداة المساعدة فئات SOP التالية:

وصف SpectacleReportStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.78.6
MacularGridThicknessAndVolumeReportStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.79.1
BasicTextSRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.11
التخزين المحسن SRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.22
تخزين SR الشامل 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.33
التخزين الشامل 3DSR 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.34
الإجراء LogStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.40
التصوير الشعاعي للثدي CADSR التخزين 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.50
KeyObjectSelectionDocumentStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.59
ChestCADSRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.65
XRayRadiation جرعة SR التخزين 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.67
المستحضرات الصيدلانية المشعة جرعة الإشعاع SR التخزين 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.68
كولونCADSRStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.69
الزرع PlanSRDocumentStorage 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.88.70

يرجى ملاحظة أنه في الوقت الحالي يتم دعم بعض السمات الإلزامية والاختيارية فقط.

حرف ترميز
يتم تحديد ترميز أحرف DICOM تلقائيًا من العنصر ذي العلامة
"0008,0005" (مجموعة الأحرف المحددة) - إن وجدت. مجموعات الأحرف التالية هي
مدعوم حاليًا (يتطلب libxml لتشمل iconv الدعم ، انظر --الإصدار انتاج):

أسكي (ISO_IR 6) (UTF-8)
UTF-8 "ISO_IR 192" (UTF-8)
ISO لاتينية 1 "ISO_IR 100" (ISO-8859-1)
ISO لاتينية 2 "ISO_IR 101" (ISO-8859-2)
ISO لاتينية 3 "ISO_IR 109" (ISO-8859-3)
ISO لاتينية 4 "ISO_IR 110" (ISO-8859-4)
ISO لاتينية 5 "ISO_IR 148" (ISO-8859-9)
سيريلي "ISO_IR 144" (ISO-8859-5)
عربي "ISO_IR 127" (ISO-8859-6)
اليونانية "ISO_IR 126" (ISO-8859-7)
عبري "ISO_IR 138" (ISO-8859-8)

مجموعات الأحرف المتعددة غير مدعومة (فقط القيمة الأولى من "الأحرف المحددة"
يتم استخدام Set 'لترميز الأحرف في حالة تعدد القيم).

ضغط
إذا تم تجميع libxml بدعم zlib ، فإن ملف الإدخال (xmlfile-in) يمكن أن يكون أيضًا
مضغوط بواسطة ZIP ، والذي ينتج عنه عادةً ملفات أصغر بكثير. انظر إخراج الخيار
--الإصدار من أجل التحقق مما إذا كان دعم zlib متاحًا.

القيود
مخطط XML dsr2xml.xsd لا يدعم كافة الاختلافات في dsr2xml تنسيق الإخراج.
ومع ذلك ، فإن تنسيق الإخراج الافتراضي (بالإضافة إلى خيار --استخدام- xml- مساحة الاسم) يجب أن تعمل.

يبدو أن الإصدارات المختلفة من libxml لها حدود مختلفة للحد الأقصى لطول ملف
قيمة عنصر XML. لذلك ، يجب تجنب استخدام قيم طويلة جدًا للعناصر. أ
الحد النموذجي للإصدار 2.7.3 (وما فوق) libxml هو 10 ميجابايت لقيمة عنصر واحد.

LOGGING

يمكن لمستوى تسجيل الإخراج لأدوات سطر الأوامر المختلفة والمكتبات الأساسية
يحدده المستخدم. بشكل افتراضي ، تتم كتابة الأخطاء والتحذيرات فقط وفقًا للمعيار
تيار الخطأ. باستخدام الخيار - الإسراف أيضًا الرسائل الإعلامية مثل تفاصيل المعالجة
تم عمل تقرير لها. خيار --Debug يمكن استخدامها للحصول على مزيد من التفاصيل حول النشاط الداخلي ،
على سبيل المثال لأغراض التصحيح. يمكن تحديد مستويات التسجيل الأخرى باستخدام الخيار --سجل-
مستوى. في --هادئ الوضع يتم الإبلاغ عن الأخطاء الفادحة فقط. في مثل هذه الأحداث الخطيرة جدًا ،
عادةً ما يتم إنهاء التطبيق. لمزيد من التفاصيل حول مستويات التسجيل المختلفة ،
انظر توثيق وحدة 'oflog'.

في حالة وجوب كتابة مخرجات التسجيل في ملف (اختياريًا مع تدوير ملف السجل) ،
إلى سجل النظام (Unix) أو خيار سجل الأحداث (Windows) --لوج التكوين يمكن استخدامها. هذه
يسمح ملف التكوين أيضًا بتوجيه رسائل معينة فقط إلى ناتج معين
تيار ولتصفية رسائل معينة بناءً على الوحدة النمطية أو التطبيق الذي توجد فيه
يتم إنشاؤها. يتم توفير مثال لملف التكوين بتنسيق /logger.cfg.

COMMAND خط

تستخدم جميع أدوات سطر الأوامر الترميز التالي للمعلمات: أرفق الأقواس المربعة
القيم الاختيارية (0-1) ، ثلاث نقاط لاحقة تشير إلى السماح بقيم متعددة
(1-n) ، مزيج من كلاهما يعني 0 إلى n قيم.

يتم تمييز خيارات سطر الأوامر عن المعلمات بعلامة "+" أو "-" بادئة ،
على التوالى. عادةً ما يكون ترتيب خيارات سطر الأوامر وموضعها تعسفيًا (أي أنها
يمكن أن تظهر في أي مكان). ومع ذلك ، إذا كانت الخيارات متنافية ، يظهر أقصى اليمين
يستخدم. يتوافق هذا السلوك مع قواعد التقييم القياسية لقذائف Unix الشائعة.

بالإضافة إلى ذلك ، يمكن تحديد ملف أو أكثر من ملفات الأوامر باستخدام علامة "@" كبادئة لـ
اسم الملف (على سبيل المثال @ command.txt). يتم استبدال حجة الأمر بمحتوى
الملف النصي المقابل (يتم التعامل مع المسافات البيضاء المتعددة كفاصل واحد ما لم يكن
تظهر بين علامتي اقتباس) قبل أي تقييم آخر. يرجى ملاحظة ذلك
لا يمكن أن يحتوي ملف الأوامر على ملف أوامر آخر. هذا نهج بسيط ولكن فعال
يسمح للمرء بتلخيص المجموعات المشتركة من الخيارات / المعلمات وتجنب longish و
أسطر الأوامر المربكة (يتم توفير مثال في ملف /dumppat.txt).

البيئة

• xml2dsr ستحاول الأداة المساعدة تحميل قواميس بيانات DICOM المحددة في ملف
DCMDICTPATH متغيرات البيئة. بشكل افتراضي ، على سبيل المثال ، إذا كان الملف DCMDICTPATH متغيرات البيئة
لم يتم تعيين الملف /dicom.dic سيتم تحميلها ما لم يتم بناء القاموس
في التطبيق (الافتراضي لنظام التشغيل Windows).

يجب تفضيل السلوك الافتراضي و DCMDICTPATH متغير البيئة فقط
تستخدم عندما تكون قواميس البيانات البديلة مطلوبة. ال DCMDICTPATH متغيرات البيئة
له نفس تنسيق غلاف يونكس PATH متغير في أن علامة النقطتين (':') تفصل
إدخالات. في أنظمة Windows ، يتم استخدام الفاصلة المنقوطة ('؛') كفاصل. قاموس البيانات
سيحاول الكود تحميل كل ملف محدد في DCMDICTPATH متغيرات البيئة. هو - هي
يعد خطأ إذا تعذر تحميل قاموس البيانات.

استخدم xml2dsr عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net