هذا هو تطبيق Linux المسمى BarraCUDA Fast Short Read Aligner والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ barracuda_0.7.107h.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى BarraCUDA Fast Short Read Aligner مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
BarraCUDA محاذاة القراءة القصيرة السريعة
الوصف
Barracuda هو جهاز محاذاة تسلسل عالي السرعة يعتمد على BWA من Sanger ويستخدم أحدث بنية Nvidia CUDA لتسريع محاذاة قراءات التسلسل التي تم إنشاؤها بواسطة أجهزة التسلسل من الجيل التالي.
المميزات
- تم إصلاح مشاكل تجميع البرنامج في Ubuntu 16.04
- القرص: تم الآن رفع حد SAMPE ثماني النواة
- قراءة تسلسل فهرس FM لبرنامج الخرائط باستخدام تسريع NVIDIA CUDA
- المخرجات بتنسيق SAM لتحليلات المصب
- يتطلب بطاقة رسومات NVIDIA بقدرة حوسبة 3.5 أو أعلى و 1 جيجابايت على الأقل VRAM
- يتطلب مجموعة أدوات NVIDIA CUDA SDK 6.x أو أعلى و NVIDIA driver 340 أو أعلى
- تم نشر BarraCUDA في BMC Research Notes 2012 ، 5:27 ، دوى: 10.1186 / 1756-0500-5-27
- URL الخاص بالورقة: http://www.biomedcentral.com/1756-0500/5/27
- هذا المشروع مدعوم من مركز الامتياز CUDA في جامعة كامبريدج
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
سي ++ ، سي
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/seqbarracuda/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
