هذا هو تطبيق Linux المسمى BIRAP والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ Sample_Files.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى BIRAP وتشغيله عبر الإنترنت مجانًا مع OnWorks.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
بيراب
الوصف
BIRAP (خط أنابيب تحليل المنطقة البكتيرية بين الجينات) هو خط أنابيب Perl مفتوح المصدر وسهل الاستخدام ويمكن استخدامه لإعادة شرح الجينومات البكتيرية باستخدام البيانات التجريبية. تدمج الأداة ملف تعريف التعبير المشتق من RNA-seq و/أو علم الجينات البروتينية، وتقارنه مع التعليقات التوضيحية الموجودة في السيليكو وتساعد في التحقق من صحة التعليقات التوضيحية، وتحديد مناطق ترميز البروتين الجديدة، والحمض النووي الريبوزي (RNA) المفترض غير المشفر، فضلاً عن المساعدة في تصحيح الأخطاء في التعليقات التوضيحية الموجودة. . يتطلب خط الأنابيب إخراج "تتراكم" من SAMtools لبيانات RNA-seq وملف موضع الببتيد/ePST (GFF) من أداة رسم الخرائط البروتيوجينية لبيانات علم الجينوم البروتيني جنبًا إلى جنب مع الجينوم والموجود في شرح السيليكو. عندما يتم توفير المعلومات المتعلقة بموقع المروجين والإنهاء في الجينوم (بتنسيق .coords)، سيساعد خط الأنابيب أيضًا في تحديد الحمض النووي الريبي (RNA) غير المشفر.
شرح المميزات:
- تحليل المنطقة الجينية للجينومات البكتيرية
- إعادة شرح الجينومات البكتيرية
- الكشف عن الحمض النووي الريبي (sRNA) الصغير
- تسلسل الحمض النووي الريبي
- علم الوراثة البروتينية
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
وحدة التحكم / المحطة الطرفية ، سطر الأوامر
لغة البرمجة
بيرل
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/birap/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
