هذا هو تطبيق Linux المسمى CStone والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم cstone.zip. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى CStone وتشغيله عبر الإنترنت مجانًا مع OnWorks.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
نغمة
الوصف
CStone هو مجمع جديد لبيانات RNA-Seq يستخدم الرسوم البيانية المشابهة لـ de Bruijn ويعلق كل contig منتجًا بواحد من ثلاثة مستويات لتصنيف الرسوم البيانية تشير إلى ما إذا كان من الممكن ضمان أن تكون غير خيالية أم لا. تعتمد مستويات التصنيف على مدى تعقيد عائلة الجينات التي تستمد منها القراءات. كمنتج ثانوي، يوفر هذا أيضًا نظرة ثاقبة للتركيب الهيكلي لعائلات الجينات الأساسية التي تم تسلسلها. مزيد من التفاصيل ستكون متاحة قريبا في ورقتنا: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
المميزات
- تجميع De novo لبيانات RNA-Seq.
- تحديد contigs غير Chimeric.
- التوافق عبر الأنظمة الأساسية.
- جرة قابلة للتنفيذ المتاحة.
- لا توجد حزم خارجية مطلوبة.
- رمز سهل المتابعة ودمجه في أدوات أخرى.
- معلومات عن تعقيد عائلات الجينات الأساسية.
- دي بروين مثل النهج (الأكثر تساهلاً).
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/cstone/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
