هذا هو تطبيق Linux المسمى EXCAVATOR-tool للتشغيل في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق وتشغيله عبر الإنترنت المسمى EXCAVATOR-tool للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
أداة EXCAVATOR للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
الوصف
تنبيه !!!!! إنتباه !!!!! إنتباه !!!!! إنتباه !!!!!نشرنا مؤخرًا على BMC Genomics حزمة برامج جديدة ، تسمى XCAVATOR ، لتحديد CNVs / CNAs من تجارب تسلسل الجينوم الكامل للقراءة القصيرة والطويلة (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR متاح مجانًا في http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR عبارة عن حزمة برامج جديدة للكشف عن متغيرات رقم النسخ (CNVs) من بيانات تسلسل كامل إكسوم.
تم نشر EXCAVATOR في Genome Biology (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
####################
انتباه!!!!! من أجل استخدام أداة EXCAVATOR بشكل صحيح ، يجب على المستخدمين تنزيل ملفات التعيين الفريدة على الرابط التالي:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (لـ hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
المميزات
- تسلسل الجيل التالي
- نسخ متغيرات الرقم
- تسلسل إكسوم الكامل
لغة البرمجة
بيرل
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/excavatortool/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.