هذا هو تطبيق Linux المسمى FusionCatcher والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له على أنه fusioncatcher_v1.33.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى FusionCatcher مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
فيوجن كاتشر
Ad
الوصف
يبحث FusionCatcher عن جينات اندماج جسدية جديدة / معروفة ، وعمليات نقل مواضع ، وكيميرات في بيانات RNA-seq (قراءات نهاية مقترنة من منصات Illumina NGS مثل Solexa و HiSeq) من العينات المريضة.
أهداف FusionCatcher هي:
- معدل اكتشاف جيد جدًا للعثور على جينات الاندماج المرشحة ،
- سهل الاستخدام للغاية (أي لا حاجة إلى معرفة مسبقة بقواعد البيانات والمعلوماتية الحيوية من أجل تشغيل FusionCatcher) ،
- اكتشاف جيد جدًا لجينات الاندماج الصعبة ، على سبيل المثال اندماج IGH ، اندماج CIC ، اندماج DUX4 ، اندماج CRLF2 ، اندماج TCF3 ، إلخ.
- أن تكون آليًا قدر الإمكان (على سبيل المثال ، سيختار FusionCatcher تلقائيًا أفضل المعلمات من أجل العثور على جينات الاندماج المرشحة ، على سبيل المثال ، إيجاد المحولات تلقائيًا ، وبناء تقاطعات exon-exon تلقائيًا بناءً على طول قراءات الإدخال ، وما إلى ذلك) مع توفير أفضل معدل اكتشاف ممكن للعثور على جينات الاندماج.
الجمهور
بحث علمي
لغة البرمجة
Python
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
