هذا هو تطبيق Linux المسمى mitoMaker والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم mitoMaker_1.0rc2.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى mitoMaker مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
ميتو ميكر
الوصف
Mitomaker عبارة عن غلاف لخطوط الأنابيب ومحلل للنتائج ومُعلق آلي ، مكتوب بلغة Python v2.7 ، والذي بمساعدة البرامج الأخرى يبني ويحلل ويبحث عن أفضل بناء ويعلق على الجينومات المستهدفة (مثل الميتوكوندريا وكلوروبلاست). يمكن استخدامه مع أهداف أخرى ، مثل الجينات المحددة ، أو النسخ ، على الرغم من أن هذا ليس الهدف الأساسي ، ولم يتم اختباره بدقة.
بعد محاولات مختلفة لبناء جينومات ميتوكوندريا مختلفة في المختبر الذي قمت بدراسته ، بدأ خط أنابيب عام في الظهور: تجميع القراءات باستخدام MIRA أو SOAPdenovo-Trans ، ابحث عن سقالة / كونتيج تتطابق مع الأنواع ذات الصلة الوثيقة ، وتحقق منها لمعرفة ما إذا كانت جميعها الميزات الجينومية المتوقعة موجودة (نظرًا لأن الميتوكوندريا محفوظة جيدًا) ، تحقق لمعرفة ما إذا كان التجميع قد يكون دائريًا (نظرًا لأنه عبارة عن DNA دائري). إذا كانت الميزة مفقودة ، أو لم يتم تعميمها ، فحاول التجميع مرة أخرى باستخدام معلمات المجمع المختلفة (بشكل أساسي k-mer). اشطفها وكررها حتى تحصل على أفضل بنية.
شرح المميزات:
- المعلوماتية الحيوية
- خط أنابيب آلي للبناء بلاستيد
- محلل الجينوم
- تجميع بلاستيد
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
وحدة التحكم / المحطة
لغة البرمجة
Python
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/plastidmaker/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
