هذا هو تطبيق Linux المسمى Pathoscope والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم pathoscope_2.0.6_clinical_pathoscope_1.0.3.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى Pathoscope مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
باثوسكوب
Ad
الوصف
هذه الصفحة هنا لغرض الأرشفة. يرجى زيارة موقع github للحصول على أحدث إصدار من البرنامج: https://github.com/pathoscopeيأخذ PathoScope قراءات تسلسل الجيل التالي من عينة خليط ويتنبأ بالجينومات الموجودة. نحن نستخدم إطار عمل بايزي جنبًا إلى جنب مع محاذاة مبدئية قائمة على المرجع لتعيين قراءات للجينوم الصحيح للأصل.
باثوسكوب 2.0:
ويكي:
http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/Home/
البرنامج التعليمي:
http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoscope2.0_v0.02_tutorial.pdf
نسخة باثوسكوب السريرية: http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/clinical_pathoscope/
تنزيل PathoQC: http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
المنشورات: http://www.microbiomejournal.com/content/2/1/33
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/262
http://genome.cshlp.org/content/23/10/1721
الدعم:
ملاحظة: يرجى إرسال بريد إلكتروني إلى mani2012 على bu dot edu إذا كان لديك أي أسئلة.
شرح المميزات:
- PathoQC: PathoQC هو برنامج مستقل لمراقبة الجودة والمعالجة المسبقة لمجموعة بيانات عالية الإنتاجية. يرجى تنزيل PathoQC من http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
- منشور PathoQC: http://la-press.com/article.php?article_id=4828
- الدعم: https://groups.google.com/d/forum/pathoscope
- صفحة المختبر: http://jlab.bu.edu/software/
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/pathoscope/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
