هذا هو تطبيق Linux المسمى Protospacer Workbench والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى Protospacer Workbench باستخدام OnWorks مجانًا عبر الإنترنت.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
منضدة بروتوسباسر
الوصف
يساعد Protospacer Workbench على تصميم المواقع المستهدفة CRISPR وتحليلها ومشاركتها لأي كائن حي أو مجموعة من التسلسلات المنسقة FASTA.تصميم دليل الحمض النووي الريبي لنظام تحرير الجينوم CRISPR / Cas سهل بشكل حدسي ، ولكنه صعب من الناحية الحسابية. تنبع الصعوبة الرئيسية من الحاجة إلى تحديد الأهداف البعيدة التي قد تكون مختلفة تمامًا عن الهدف المقصود. توفر الأدوات الحالية المتوفرة عبر الإنترنت لتصميم guide-RNA واجهة سهلة الاستخدام لبرامج رسم الخرائط التسلسلية مثل Bowtie أو BLAST. ومع ذلك ، في حين أن خوارزميات التعيين هذه سريعة ، لم يتم تصميمها بدرجة تحمل عالية للخطأ ، وهي ميزة حاسمة لتحديد الأهداف غير المحتملة المحتملة. عندما تفشل الأدوات عبر الإنترنت ، تنجح الأدوات غير المتصلة بالإنترنت. ومع ذلك ، تتطلب الأدوات غير المتصلة بالإنترنت معرفة سطر الأوامر الذي يمتلكه القليل ممن يستخدمون تقنية كريسبر. يهدف Protospacer Workbench إلى سد الفجوة بين تصميم الدليل RNA عبر الإنترنت وغير متصل. البرنامج متاح حاليًا لنظام التشغيل OS X وسيتم نقله إلى أنظمة تشغيل أخرى قريبًا.
المميزات
- اعثر على جميع أهداف CRISPR المتاحة بسرعة
- تقييم تصميمات guide-RNA بدقة
- أهداف حصة وقوائم دليل الحمض النووي الريبي
- تصميم لأي كائن حي
- إدارة قواعد بيانات متعددة
- سير العمل خطوة بخطوة
- احصل على تقارير حول الأداء المتوقع لـ guide-RNA
- استفد من أدوات جهات خارجية متعددة من واجهة واحدة
- تصميم متعدد الأهداف
- إدارة الهدف الكبير / قوائم RNA الدليل
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
