هذا هو تطبيق Linux المسمى SnowyOwl والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم SnowyOwl-2.0.3.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى SnowyOwl مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
البومة الثلجية
الوصف
SnowyOwl هو خط أنابيب للتنبؤ بالجينات يستخدم بيانات RNA-Seq للتدريب وتقديم تلميحات لتوليد تنبؤات الجينات المستندة إلى Hidden Markov Model (HMM) ، ولتقييم النماذج الناتجة. تم التحقق من صحة خط الأنابيب وتبسيطه من خلال مقارنة تنبؤاته بنماذج الجينات المنسقة يدويًا في ثلاثة جينومات فطرية ، وتظهر نتائجه زيادات كبيرة في الحساسية والانتقائية مقارنة بالتنبؤات الجينية السابقة. يتم اكتساب الحساسية من خلال تشغيل متنبئ الجين HMM Augustus بشكل متكرر بمعلمات إدخال متنوعة ، والانتقائية عن طريق اختيار النماذج ذات التماثل الأفضل للبروتينات المعروفة وأفضل اتفاق على بيانات RNA-Seq. تنبأ SnowyOwl بنجاح بجينات في 26 جينوم فطري جديد.
يمكن تثبيت خط الأنابيب محليًا لتحقيق إنتاجية عالية والتحكم في التكوين. يمكن أيضًا تشغيله على خادم بعيد من خلال واجهة ويب ملائمة للاستخدام العرضي.
المميزات
- التنبؤ الجيني باستخدام بيانات RNA-Seq
- حساسية وخصوصية عالية
- تم تبسيط خطوط الأنابيب والتحقق من صحتها باستخدام نماذج الجينات المنسقة يدويًا
- شكلي للغاية
- التكوين الافتراضي للفطريات غير الفطرية والقاعدة
- قم بالتثبيت والتشغيل محليًا للتحكم والمرونة
- يمكنك التشغيل عن بُعد من خلال واجهة ويب للراحة
الجمهور
العلوم / البحث ، المستخدمون النهائيون المتقدمون
واجهة المستخدم
على شبكة الإنترنت ، سطر الأوامر ، GTK +
لغة البرمجة
بايثون ، PHP
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/snowyowl/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
