هذا هو تطبيق Linux المسمى Subread الذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باعتباره subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى Subread with OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
مقروء
Ad
الوصف
حزمة برامج Subread عبارة عن مجموعة أدوات لمعالجة بيانات تسلسل الجيل التالي. يتضمن Subread aligner ، وكاشف تقاطع Subjunc exon-exon ، وبرنامج تلخيص قراءة featureCounts.
يمكن استخدام التقويم الفرعي لمحاذاة كل من قراءة gDNA-seq و RNA-seq. تم تحديد محاذاة Subjunc خصيصًا لاكتشاف تقاطع exon-exon. لتعيين قراءات RNA-seq ، يقوم Subread بإجراء محاذاة محلية ويقوم Subjunc بإجراء محاذاة عامة. تم نشر Subread و Subjunc في الورقة التالية: Yang Liao و Gordon K Smyth و Wei Shi. "The Subread aligner: تخطيط قراءة سريع ودقيق وقابل للتطوير عن طريق البذور والتصويت" ، Nucleic Acids Research ، 2013 ، 41 (10): e108
المميزات
- قراءة التقويم
- تسلسل الجيل القادم
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
C
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/subread/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.