هذا هو تطبيق Windows المسمى CRISPR-offinder-v1-2 والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم CRISPR-offinder-1.2.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى CRISPR-offinder-v1-2 مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل أي محاكي لنظام التشغيل OnWorks عبر الإنترنت من موقع الويب هذا ، ولكن أفضل محاكي Windows عبر الإنترنت.
- 5. من نظام التشغيل OnWorks Windows الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته.
- 7. قم بتنزيل Wine من مستودعات برامج توزيعات Linux الخاصة بك. بمجرد التثبيت ، يمكنك النقر نقرًا مزدوجًا فوق التطبيق لتشغيله باستخدام Wine. يمكنك أيضًا تجربة PlayOnLinux ، وهي واجهة رائعة على Wine والتي ستساعدك على تثبيت برامج وألعاب Windows الشائعة.
يعد Wine طريقة لتشغيل برامج Windows على نظام Linux ، ولكن بدون الحاجة إلى Windows. Wine عبارة عن طبقة توافق Windows مفتوحة المصدر يمكنها تشغيل برامج Windows مباشرة على أي سطح مكتب Linux. بشكل أساسي ، يحاول Wine إعادة تنفيذ ما يكفي من Windows من البداية حتى يتمكن من تشغيل جميع تطبيقات Windows دون الحاجة إلى Windows بالفعل.
SCREENSHOTS
Ad
كريسبر-offinder-v1-2
الوصف
لا شك أن نظام كريسبر/كاس يحمل إمكانات كبيرة لتحرير الجينوم. يتطلب انقسام الموقع المستهدف بواسطة تقنية CRISPR نموذجًا مجاورًا للفاصل الأولي (PAM) مباشرة أسفل أو أعلى عنصر المباعد الأولي الذي يرتبط به sgRNA. ومع ذلك، Cas9 من أنواع مختلفة من البكتيريا أو البديل يتعرف على تسلسلات PAM مختلفة. لتلبية احتياجات أنظمة كريسبر المختلفة مع تصميم sgRNA محدد وفعال، تم تطوير CRISPR-offinder.
بالنظر إلى ملف FASTA المدخل للمواقع المستهدفة والاستعلام عن الجينوم المرجعي بالإضافة إلى نظام CRISPR بطول فاصل محدد وتسلسل PAM، ستحدد هذه الأداة المستقلة المواقع المفترضة وتعيين نشاطًا متوقعًا استنادًا إلى نموذج آلة ناقل الدعم الذي يتم إجراؤه بواسطة سجرنا هداف 2.0. بالإضافة إلى ذلك، تم توقع sgRNAs مع الحد الأدنى من النشاط خارج الهدف بواسطة Cas-OFFinder، وسجل مع تحديد تردد القطع خارج الهدف (CFD).
المميزات
- يمكن لـ CRISPR-offinder أن يزود عالم الأحياء بأداة لتحديد المواقع المستهدفة عالية الجودة بسرعة وكفاءة
- يمكن استخدام هذا البرنامج لتصميم مكتبات sgRNA لأي نوع
- تشاو وآخرون، (2017) CRISPR-offinder: دليل CRISPR لتصميم الحمض النووي الريبي (RNA) وأداة بحث خارج الهدف عن الشكل المجاور للمباعد الأولي المحدد من قبل المستخدم. المجلة الدولية للعلوم البيولوجية
لغة البرمجة
بيرل
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/crispr-offinder-v1-2/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
