এটি হল autodock4 কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
অটোডক - প্রোটিন রিসেপ্টরগুলিতে রাসায়নিক লিগ্যান্ডের ডকিং
সাইনোপিসিস
autodock4 [অপশন]
বর্ণনাঃ
অটোডক প্রোটিনে রাসায়নিক যৌগগুলির স্বয়ংক্রিয় ডকিং সম্পাদন করে, অর্থাৎ এটি ভবিষ্যদ্বাণী করে
কিভাবে ছোট অণু, যেমন সাবস্ট্রেট বা ড্রাগ প্রার্থী, পরিচিত 3D এর রিসেপ্টরের সাথে আবদ্ধ হয়
কাঠামো।
AutoDockSuite দুটি প্রধান প্রোগ্রাম নিয়ে গঠিত যার মধ্যে অটোডক ডকিং করে
গ্রিডের একটি সেটে লিগ্যান্ড লক্ষ্য প্রোটিন বর্ণনা করে এবং অটোগ্রিড প্রাক-গণনা করে
এই গ্রিড.
বিকল্প
-p parameter_filename
-l log_filename
-o পুরানো PDBQ ফর্ম্যাট ব্যবহার করুন, 55-61 কলামে q চার্জ করুন
-k মূল অবশিষ্টাংশ নম্বর রাখুন
-i হেডার-চেকিং উপেক্ষা করুন
-t টরশন চেক করতে PDBQ ফাইল পার্স করুন, তারপর থামুন।
-c < command_file কমান্ড মোড, ফাইল দ্বারা
-c | control_program কমান্ড মোড, control_program দ্বারা
EXAMPLE টি
ডেবিয়ানে, ডিরেক্টরি /usr/share/doc/autodock চালানোর উদাহরণ দেয়। যে পরিবর্তন
ডিরেক্টরি এবং জিজিপড ম্যাপ ফাইলগুলি আনপ্যাক করুন (রুট হিসাবে), তারপর দেখানো হিসাবে অটোডক চালান
নিচে:
gunzip *.map.gz
autodock4 -p 1pgp.dpf -l /tmp/1pgp.dlg
ফলাফলের ব্যাখ্যা AutoDockTools স্যুট দ্বারা সাহায্য করা হয়। এছাড়াও পরিদর্শন করুন
অনলাইনে দেওয়া টিউটোরিয়াল।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে autodock4 ব্যবহার করুন
