এটি হল bp_sreformatp কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
bpsreformat - ক্রম বিন্যাস রূপান্তর
বর্ণনাঃ
এই স্ক্রিপ্টটি SeqIO সিস্টেম ব্যবহার করে যা ক্রম বিন্যাস রূপান্তর করার অনুমতি দেয়
সিকোয়েন্স ডেটা বা একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট ডেটা। নামটি আসলে শন থেকে এসেছে
এডির প্রোগ্রাম sreformat (HMMER pkg এর অংশ) ইতিমধ্যেই এটি করে। শন এর প্রোগ্রাম চেষ্টা করে
আমাদের কোডে থাকাকালীন ইনপুট ফরম্যাটগুলি অনুমান করতে আমরা বর্তমানে আপনার কী তা নির্দিষ্ট করতে চাই৷
ইনপুট এবং আউটপুট ফরম্যাট এবং যদি ডেটা একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট বা থেকে হয়
সোজা ক্রম ফাইল।
ব্যবহার:
bpsreformat -যদি INFORMAT -of OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h/--help এই সাহায্য প্রিন্ট করুন
-if/--informat ইনপুট বিন্যাস উল্লেখ করুন
-of/--outformat আউটপুট বিন্যাস উল্লেখ করুন
-i/--input ইনপুট ফাইলের নাম উল্লেখ করুন
(STDIN-এ ডেটা পাস করার জন্য ফাইলের নাম হিসাবে বিয়োগ চিহ্ন ব্যবহার করুন)
-o/--output আউটপুট ফাইলের নাম উল্লেখ করুন
(STDOUT-এ ডেটা পাস করার জন্য ফাইলের নাম হিসাবে বিয়োগ চিহ্ন ব্যবহার করুন)
--msa নির্দিষ্ট করুন এটি একাধিক সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট ডেটা
--special বিশেষ প্যারামিটারগুলি AlignIO/SeqIO-তে প্রেরণ করবে
অবজেক্ট -- এর বেশিরভাগই Bio::AlignIO অবজেক্টের জন্য
নিচের কমা থেকে আলাদা করা তালিকা
অ-ইন্টারলিভড -- ফিলিপ, নন-ইন্টারলিভড ফরম্যাটের জন্য
idlinebreak -- ফিলিপের জন্য, এটিকে molphy বিন্যাস করে
শতাংশ -- ক্লাস্টালের জন্য, প্রতি লাইনে % আইডি দেখান
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে bp_sreformatp ব্যবহার করুন