cmfetch - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

cmfetch - একটি ফাইল থেকে কোভেরিয়েন্স মডেল(গুলি) পুনরুদ্ধার করুন

সাইনোপিসিস

cmfetch [বিকল্প]
(সিএম নামের পুনরুদ্ধার করে )

cmfetch -f [বিকল্প]
(এ তালিকাভুক্ত সমস্ত সিএম পুনরুদ্ধার করে )

cmfetch --সূচক [বিকল্প]
(সূচিপত্র আনার জন্য)

বর্ণনাঃ

একটি থেকে এক বা একাধিক CM পুনরুদ্ধার করে৷ (উদাহরণস্বরূপ, একটি বড় Rfam ডাটাবেস)।

খুব দ্রুত পুনরুদ্ধার সক্ষম করতে, সূচী প্রথম, ব্যবহার করে cmfetch --সূচক। সূচক
নামের একটি বাইনারি ফাইল .ssi

ডিফল্ট মোড হল নাম বা যোগসূত্র দ্বারা একটি একক সিএম পুনরুদ্ধার করা, যাকে বলা হয় . জন্য
উদাহরণস্বরূপ:

% cmfetch Rfam.cm tRNA
% cmfetch Rfam.cm RF00005

সঙ্গে সঙ্গে -f বিকল্প, ক পরিবর্তে এক বা একাধিক কীগুলির একটি তালিকা ধারণ করা হয়।
প্রথম হোয়াইটস্পেস-ডিলিমিটেড ক্ষেত্র প্রতিটি অ-খালি নন-কমেন্ট লাইনে
হিসাবে ব্যবহৃত হয় , এবং লাইনের যেকোন অবশিষ্ট তথ্য উপেক্ষা করা হয়। এটি বিভিন্ন করার অনুমতি দেয়
হোয়াইটস্পেস সীমাবদ্ধ ডেটাফাইল হিসাবে ব্যবহার করা হবে s

ব্যবহার করার সময় -f এবং একটি , if ইনডেক্স করা হয়েছে, কীগুলি পুনরুদ্ধার করা হয়েছে
অর্ডার তারা ঘটতে , কিন্তু যদি ইনডেক্স করা হয় না, কীগুলি পুনরুদ্ধার করা হয়
ক্রম তারা ঘটতে . এটি একটি বাস্তবায়ন একটি পার্শ্ব প্রতিক্রিয়া যে
একাধিক কী পুনরুদ্ধার করার অনুমতি দেয় এমনকি যদি একটি nonrewindable স্ট্রীম, মত
একটি আদর্শ ইনপুট পাইপ।

সাধারণ ব্যবহারে (ব্যতীত --সূচক or -f বিকল্প), হতে পারে '-' (ড্যাশ), যার অর্থ
থেকে ইনপুট পড়া stdin একটি ফাইলের পরিবর্তে। সঙ্গে --সূচক বিকল্প, সম্ভবত না
'-'; একটি স্ট্যান্ডার্ড ইনপুট স্ট্রীম সূচী করার কোন মানে হয় না। সঙ্গে -f বিকল্প, হয়
or (কিন্তু উভয় নয়) '-' হতে পারে। এটি প্রায়ই পড়তে বিশেষভাবে দরকারী
স্ট্যান্ডার্ড ইনপুট থেকে, কারণ এটি ব্যবহারকে নির্বিচারে কমান্ড লাইন ব্যবহার করার অনুমতি দেয়
সিএম নাম বা অ্যাক্সেসের একটি তালিকা তৈরি করার জন্য আহ্বান, তারপর সেগুলিকে একটি নতুন ফাইলে আনুন,
শুধু একটি আদেশ দিয়ে।

ডিফল্টরূপে, ইনফারনাল-1.1 বিন্যাসে CM স্ট্যান্ডার্ড আউটপুটে প্রিন্ট করা হয়।

বিকল্প

-h সাহায্য; কমান্ড লাইন ব্যবহার এবং সমস্ত উপলব্ধ বিকল্পগুলির একটি সংক্ষিপ্ত অনুস্মারক মুদ্রণ করুন।

-f দ্বিতীয় কমান্ডলাইন আর্গুমেন্ট হল a একক পরিবর্তে . সার্জারির
প্রতিটি লাইনের প্রথম ক্ষেত্র পুনরুদ্ধার হিসাবে ব্যবহৃত হয় (একটি সিএম নাম
বা যোগদান)। ফাঁকা লাইন এবং মন্তব্য লাইন (যেটি একটি # অক্ষর দিয়ে শুরু হয়)
উপেক্ষা করা

-o ফাইলে আউটপুট CM(গুলি) স্ট্যান্ডার্ড আউটপুটের পরিবর্তে।

-O আউটপুট CM(গুলি) পৃথক ফাইল(গুলি) নামক স্ট্যান্ডার্ড আউটপুটের পরিবর্তে। সঙ্গে
-f বিকল্প, এর ফলে অনেক ফাইল তৈরি হতে পারে।

--সূচক
থেকে এক বা একাধিক প্রোফাইল পুনরুদ্ধার করার পরিবর্তে , সূচক উন্নত
ভবিষ্যতের পুনরুদ্ধার এটি একটি তৈরি করে .ssi বাইনারি সূচক ফাইল।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে cmfetch ব্যবহার করুন