এটি হল কমান্ড কমপ্যালাইন যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
compalign - দুটি একাধিক প্রান্তিককরণ তুলনা করুন
সাইনোপিসিস
compalign [-বিকল্প]
বর্ণনাঃ
compalign বিশ্বস্ত সারিবদ্ধকরণ এবং পরীক্ষার মধ্যে ভগ্নাংশের "পরিচয়" গণনা করে
প্রান্তিককরণ দুটি ফাইলে অবশ্যই একই ক্রম থাকতে হবে, ঠিক একইভাবে
অর্ডার।
মাল্টিপল সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্টের পরিচয়কে গড় পরিচয় হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়
সমস্ত N(N-1)/2 জোড়া সারিবদ্ধকরণ।
পেয়ারওয়াইজ অ্যালাইনমেন্টের দুটি সেটের ভগ্নাংশের পরিচয়টি নিম্নরূপ সংজ্ঞায়িত করা হয়েছে
(সারিবদ্ধ পরিচিত ক্রম k1 এবং k2, এবং প্রান্তিককৃত পরীক্ষার ক্রম t1 এবং t2 এর জন্য):
মিলিত কলাম / মোট কলাম
যেখানে মোট কলাম = মোট কলামের সংখ্যা যেখানে আছে
k1 বা k2-তে একটি বৈধ (nongap) প্রতীক;
মিলিত কলাম = কলামের সংখ্যা যার মধ্যে একটি
নিম্নলিখিত সত্য:
একটি প্রদত্ত কলামে k1 এবং k2 উভয়েরই বৈধ চিহ্ন রয়েছে; t1 এবং t2
t1/t2 এর একটি কলামে একই চিহ্নগুলি সারিবদ্ধ করুন
প্রান্তিককরণ;
k1-এ k2-এর ফাঁকে সারিবদ্ধ একটি চিহ্ন রয়েছে; t1 তে সেই চিহ্নটি হল
এছাড়াও একটি ফাঁক সারিবদ্ধ;
k2-এ k1-এর ফাঁকে সারিবদ্ধ একটি চিহ্ন রয়েছে; t2 তে সেই চিহ্নটি হল
এছাড়াও একটি ফাঁক সারিবদ্ধ.
যেহেতু সমস্ত সম্ভাব্য জোড়ার জন্য স্কোর গণনা করা হয়, অ্যালগরিদমটি ক্রমানুসারে (N^2)L
দৈর্ঘ্য L এর N ক্রম; বড় ক্রম সেট কিছু সময় লাগবে.
বিকল্প
উপলব্ধ বিকল্প:
-h সংক্ষিপ্ত সাহায্য এবং ব্যবহারের তথ্য প্রিন্ট করুন।
-c শুধুমাত্র চিহ্নিত #=CS ঐক্যমত্য কাঠামোর অধীনে তুলনা করুন।
-- তথ্য
উল্লেখ করুন যে উভয় প্রান্তিককরণ বিন্যাসে রয়েছে (উদাহরণস্বরূপ MSF)।
-- শান্ত
ভার্বোস হেডার দমন করুন (রিগ্রেশন পরীক্ষায় ব্যবহৃত)।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইন কম্পালাইন ব্যবহার করুন
