এটি হল ডিমুক্স কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
demux - XPLOR দূরত্ব সীমাবদ্ধতাকে Gromacs বিন্যাসে রূপান্তর করুন
সাইনোপিসিস
demux md0.log অতিরিক্ত
বর্ণনাঃ
আপনি যদি আপনার ট্র্যাজেক্টরিগুলিকে আবার অবিচ্ছিন্ন করতে চান তবে আপনি ব্যবহার করতে পারেন demux পড়তে
আপনার md0.log ফাইল (প্রয়োজনে আপনি বেশ কয়েকটি সংযুক্ত করতে পারেন) এবং কয়েকটি আউটপুট তৈরি করুন
নথি পত্র. এর মধ্যে একটি হল একটি .xvg ফাইল (replica_ndx.xvg) যা পাস করা যেতে পারে trjcat(২০১০) বরাবর
ক্রমাগত ট্রাজেক্টোরি তৈরি করার জন্য মূল ট্রাজেক্টরি ফাইলের সাথে। অন্যটি
ফাইল (replica_temp.xvg) থেকে শুরু করে প্রতিটি প্রতিরূপের জন্য তাপমাত্রা রয়েছে
মূল তাপমাত্রা। তাই যদি আপনার আগ্রহের প্রতিরূপ শুরু হয়, বলুন, 300 K, আপনি অনুসরণ করতে পারেন
তাপমাত্রা স্থান মাধ্যমে তার গতিপথ. এটা কিছু যোগ করা আকর্ষণীয় হবে
প্রতিটি প্রতিরূপের জন্য তাপমাত্রা বিতরণের হিস্টোগ্রাম তৈরি করার কার্যকারিতা, যা
বেশিরভাগ লেখকের মতে, সমতল হওয়া উচিত। demuxed trajectories সঙ্গে ব্যবহার করা যেতে পারে
g_kinetics(২০১০) REMD ট্রাজেক্টোরি থেকে প্রোটিন ভাঁজ গতিবিদ্যা প্রাপ্ত করতে।
বিকল্প
md0.log আপনি ক্রমাগত করতে চান ট্রাজেক্টোরি রানের লগ ফাইল। একাধিক ফাইল হতে পারে
একসাথে যুক্ত।
অতিরিক্ত লগ ফাইলের প্রতিটি এন্ট্রি কতবার কপি করা হবে। (পূর্ণসংখ্যা)
সীমাবদ্ধতা
যদি আপনার বিনিময় প্রতিটি N ps হয় এবং আপনি প্রতিটি M ps সংরক্ষণ করেন তাহলে আপনি অনুপস্থিতটির জন্য করতে পারেন
সেট করে ফ্রেম অতিরিক্ত থেকে (N/M - 1)। N/M পূর্ণসংখ্যা না হলে, আপনি ভাগ্যের বাইরে এবং আপনি
আপনার ট্র্যাজেক্টোরিগুলিকে মোটেও ডিমাক্স করতে সক্ষম হবে না।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে demux ব্যবহার করুন