এটি হল em_conse কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
cons - একটি একাধিক প্রান্তিককরণ থেকে একটি ঐক্যমত্য ক্রম তৈরি করুন
সাইনোপিসিস
কনস -ক্রম seqset [-তথ্য ফাইল জরায়ু] [- বহুত্ব ভাসা] [-পরিচয় পূর্ণসংখ্যা]
[-সেটকেস ভাসা] -আউটসেক seqout [-আম স্ট্রিং]
কনস -হেল্প
বর্ণনাঃ
কনস এটি EMBOSS ("ইউরোপীয় মলিকুলার বায়োলজি ওপেন সফটওয়্যার) থেকে একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম
সুইট"). এটি "অ্যালাইনমেন্ট: কনসেনসাস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম seqset
একটি ক্রম প্রান্তিককরণ ধারণকারী ফাইল।
-তথ্য ফাইল জরায়ু
এটি স্কোরিং ম্যাট্রিক্স ফাইল যা ক্রম তুলনা করার সময় ব্যবহৃত হয়। ডিফল্টরূপে এটি
ফাইল 'EBLOSUM62' (প্রোটিনের জন্য) অথবা ফাইল 'EDNAFULL' (নিউক্লিক সিকোয়েন্সের জন্য)। এইগুলো
ফাইলগুলি EMBOSS ইনস্টলেশনের 'ডেটা' ডিরেক্টরিতে পাওয়া যায়।
অতিরিক্ত অধ্যায়
- বহুত্ব ভাসা
ইতিবাচক ম্যাচের সংখ্যার জন্য একটি কাট-অফ সেট করুন যার নিচে কোন ঐক্যমত নেই।
ডিফল্ট বহুত্বকে সমস্ত সিকোয়েন্সের মোট ওজনের অর্ধেক হিসাবে নেওয়া হয়৷
প্রান্তিককরণ ডিফল্ট মান: @( $(sequence.totweight) / 2)
-পরিচয় পূর্ণসংখ্যা
এটির জন্য একটি সাইটে প্রয়োজনীয় সংখ্যক পরিচয় সেট করার সুবিধা প্রদান করে
যে অবস্থানে একটি ঐক্যমত্য দিন. অতএব, যদি এই সংখ্যা সেট করা হয়
প্রান্তিককরণের ক্রমগুলি শুধুমাত্র পরিচয়ের কলামগুলি ঐকমত্যে অবদান রাখে।
-সেটকেস ভাসা
ইতিবাচক মিলগুলির জন্য থ্রেশহোল্ড সেট করে যার উপরে ঐকমত্যটি বড় হাতের
এবং যার নিচে ঐকমত্যটি নিম্ন ক্ষেত্রে। ডিফল্ট মান: @(
$(sequence.totweight) / 2)
আউটপুট অধ্যায়
-আউটসেক seqout
-আম স্ট্রিং
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে em_conse ব্যবহার করুন
