এটি হল gff2ps কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
gff2ps - GFF-ফাইল থেকে পোস্টস্ক্রিপ্ট গ্রাফিকাল আউটপুট তৈরি করে।
সাইনোপিসিস
gff2ps [বিকল্প] -- gff_files
বর্ণনাঃ
এই প্রোগ্রামটি জিএফএফ-ফরম্যাটেড ডেটা ক্ষেত্র সহ ফাইলগুলি থেকে রঙ-ভরা ডটপ্লট আঁকে। দ্য
প্রোগ্রামটি GFF ফরম্যাটে জিনোমিক সিকোয়েন্সে টীকাযুক্ত বৈশিষ্ট্যগুলি ইনপুট হিসাবে নেয় এবং
পোস্টস্ক্রিপ্টে একটি ভিজ্যুয়াল আউটপুট তৈরি করে।
বিকল্প
-h বিকল্পগুলির সারাংশ দেখান।
-H
শুধুমাত্র নির্দিষ্ট বিকল্পের জন্য সাহায্য দেখায়।
-V ভার্বোস মোড, একটি সম্পূর্ণ রিপোর্ট স্ট্যান্ডার্ড ত্রুটিতে পাঠানো হয় (ডিফল্ট শুধুমাত্র পাঠায়
সতর্কতা)।
-v নীরব মোড: সমস্ত সতর্কতা অক্ষম করুন, স্ট্যান্ডার্ড ত্রুটিতে কোনো বার্তা পাঠানো হয়নি।
-d ডিফল্ট কাস্টমফাইল লিখুন (বা বিদ্যমান থাকলে পুনরায় লিখুন)।
-D
প্রদত্ত ফাইলের নাম দিয়ে একটি নতুন ডিফল্ট কাস্টমফাইল তৈরি করুন।
-C
প্রদত্ত কাস্টম ফাইল লোড করুন এবং ডিফল্ট কাস্টম ফাইলে (.gff2psrc) যুক্ত করুন।
-s
পৃষ্ঠার আকার পরিবর্তন করতে দরকারী (ডিফল্ট হল a4)।
-p পৃষ্ঠার অভিযোজন পোর্ট্রেটে স্যুইচ করে (ডিফল্ট হল ল্যান্ডস্কেপ)।
-G
FOREGROUND এর জন্য রঙ সেট করে (ডিফল্ট কালো)।
-g
ব্যাকগ্রাউন্ডের জন্য রঙ সেট করে (ডিফল্ট সাদা)।
-P <#> আপনার আউটপুট বিভক্ত করার জন্য কতগুলি পৃষ্ঠা প্রয়োজন তা সেট করে (ডিফল্ট একটি)।
-S <#> প্রথম নিউক্লিওটাইড জুম করুন (ডিফল্ট হল সিকোয়েন্স অরিজিন)।
-E <#> শেষ নিউক্লিওটাইড জুম করুন (ডিফল্ট হল ক্রম দৈর্ঘ্য)।
-B <#> প্রতি পৃষ্ঠায় ব্লক সেট করে (ডিফল্ট একটি)।
-N <#> প্রতি লাইনে নিউক্লিওটাইড সেট করে (ডিফল্ট হল ইনপুট জিএফএফ থেকে বৃহত্তম ক্রম অবস্থান-
নথি পত্র).
-b বাম থেকে ডানে এবং উপরে থেকে নীচে ব্লক (ডিফল্ট প্রথমে উপরে থেকে নীচে)।
-L হেডার বন্ধ করুন (শিরোনাম এলাকা)।
-T
শিরোনাম সংজ্ঞায়িত করা (ডিফল্ট হল ইনপুট gff ফাইলের নাম)।
-t
সাবটাইটেল সংজ্ঞায়িত করা (ডিফল্ট কোনটি নয়)।
-l পৃষ্ঠা নম্বর প্রদর্শন করে না।
-O তারিখ দেখায় না।
-o সময় দেখায় না।
-M <#> প্রতি লাইনে প্রধান টিকমার্কের সংখ্যা (ডিফল্ট 10)।
-K <#> নিউক্লিওটাইডে প্রধান টিকমার্ক স্কেল, লাইনের জন্য ডিফল্ট হল নিউক্লিওটাইড দৈর্ঘ্য
প্রধান টিকমার্ক সংখ্যা দ্বারা ভাগ (বিকল্প -T দেখুন)।
-m <#> প্রধান টিকমার্কের মধ্যে ছোট টিকমার্কের সংখ্যা (ডিফল্ট 10)।
-k <#> নিউক্লিওটাইডে ক্ষুদ্র টিকমার্ক স্কেল ডিফল্ট প্রধান টিকমার্কের আকার দ্বারা বিভক্ত
ছোট টিকমার্ক সংখ্যা (বিকল্প -t দেখুন)।
-w, -f ফরওয়ার্ড-স্ট্র্যান্ড (ওয়াটসন) উপাদান প্রদর্শন বন্ধ করুন।
-গ, -r রিভার্স-স্ট্র্যান্ড (ক্রিক) উপাদান প্রদর্শন বন্ধ করুন।
-i স্ট্র্যান্ড-স্বাধীন উপাদান প্রদর্শন বন্ধ করুন।
-0
ফ্রেমের জন্য রঙ সেট করে "0" (ডিফল্ট নীল)।
-1 ফ্রেমের জন্য রঙ সেট করে "1" (ডিফল্ট লাল)।
-2 ফ্রেমের জন্য রঙ সেট করে "2" (ডিফল্ট সবুজ)।
-3 ফ্রেমের জন্য রঙ সেট করে "।" (ডিফল্ট কমলা)।
-n উপাদান অবস্থানের জন্য লেবেল বন্ধ করুন.
-a প্লটে কপিরাইট লাইন বন্ধ করুন।
পরিবেশ বৈচিত্র্য
তিনটি পরিবেশগত ভেরিয়েবল রয়েছে যা ব্যবহারকারীদের দ্বারা তাদের পছন্দ অনুসারে সেট করা যেতে পারে:
+ আপনি সেই পথটি নির্দিষ্ট করতে পারেন যেখানে GFF2PS শেল সহ ডিফল্ট ফাইলগুলি খুঁজে পেতে পারে
পরিবর্তনশীল "GFF2PS_CFDIR"। ডিফল্ট মান হল সেই পথ যেখানে আপনি GFF2PS চালাচ্ছেন।
+ আপনি ভেরিয়েবলের সাথে আপনার পছন্দের ডিফল্ট কাস্টম ফাইলের নামটিও সংজ্ঞায়িত করতে পারেন
"GFF2PS_CUSTOMFILE", কাস্টম ফাইলের জন্য প্রোগ্রামের ডিফল্ট ফাইলের নাম হল ".gff2psrc"।
+ GFF2PS কে বর্তমানের জন্য অনুমতি সহ একটি ডিরেক্টরিতে কয়েকটি অস্থায়ী ফাইল লিখতে হবে
ব্যবহারকারী পড়তে এবং লিখতে। ডিফল্ট অস্থায়ী ডিরেক্টরি পথ "এ সেট করা আছে/ Tmp / '"কিন্তু তুমি পারবে
ভেরিয়েবল "GFF2PS_TMP" ব্যবহার করে একটি ভিন্ন অস্থায়ী ডিরেক্টরি পাথ বরাদ্দ করুন।
Bourne-shell (bash) এ সেই ভারগুলি সেট করা হচ্ছে:
GFF2PS_CFDIR="পথ" রপ্তানি করুন
এক্সপোর্ট GFF2PS_CUSTOMFILE="file_name"
GFF2PS_TMP="পথ" রপ্তানি করুন
একটি C-Shell ব্যবহার করে (csh):
setenv GFF2PS_CFDIR "পথ"
setenv GFF2PS_CUSTOMFILE "file_name"
setenv GFF2PS_TMP "পথ"
মন্তব্য
* সংজ্ঞায়িত রং হল:
মৌলিক রং: কালো সাদা
পরিবর্তনশীল রং: ধূসর ম্যাজেন্টা বেগুনি নীল আকাশী নীল সায়ান সামুদ্রিক সবুজ চুন সবুজ হলুদ
কমলা লাল বাদামী
আপনি "ভেরিডার্ক", "ডার্ক", "লাইট" এবং ভেরিয়েবল কালার থেকে পাঁচটি রঙের শেড পেতে পারেন।
"খুব হালকা" উপসর্গ। একটি উদাহরণ: খুব গাঢ় সাগরসবুজ অন্ধকারসাগরীয় সীগ্রিন লাইটসিগ্রিন
খুব হালকা সমুদ্রসবুজ
* পৃষ্ঠার আকার সংজ্ঞায়িত করা হয়:
A0 থেকে A10, B0 থেকে B10 থেকে, 10x14, এক্সিকিউটিভ, ফোলিও, লেজার, আইনি, চিঠি, কোয়ার্টো,
বিবৃতি এবং ট্যাবলয়েড।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gff2ps ব্যবহার করুন
