এটি হল glam2scan কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
glam2scan - একটি ডাটাবেসে একটি GLAM2 মোটিফ খুঁজে পায়
সাইনোপিসিস
glam2scan [অপশন] বর্ণমালা my_motif.glam2 my_seqs.fa
ব্যতীত অন্য একটি বর্ণমালা p or n একটি বর্ণমালা ফাইলের নাম হিসাবে ব্যাখ্যা করা হয়।
বর্ণনাঃ
glam2scan একটি ক্রম ডাটাবেসে, দ্বারা আবিষ্কৃত একটি মোটিফের সাথে মিল খুঁজে পায় glam2। প্রতি
ম্যাচটি একটি স্কোর পায়, যা নির্দেশ করে যে এটি মোটিফের সাথে কতটা উপযুক্ত।
বিকল্প (ডিফল্ট সেটিংস)
-h
সমস্ত বিকল্প এবং তাদের ডিফল্ট সেটিংস দেখান।
-o
আউটপুট ফাইল (stdout).
-n
রিপোর্ট করার জন্য প্রান্তিককরণের সংখ্যা (25).
-2
উভয় strands পরীক্ষা করুন - এগিয়ে এবং বিপরীত পরিপূরক।
-D
সিউডোকাউন্ট মুছে ফেলা (0.1).
-E
নো-ডিলিট সিউডোকাউন্ট (2.0).
-I
সন্নিবেশ সিউডোকাউন্ট (0.02).
-J
নো-ইনসার্টেশন সিউডোকাউন্ট (1.0).
-d
Dirichlet মিশ্রণ ফাইল.
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে glam2scan ব্যবহার করুন