এটি হল gt-eval কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
gt-eval - টীকা ফাইল তুলনা করুন এবং সঠিকতা পরিমাপ দেখান (ভবিষ্যদ্বাণী বনাম রেফারেন্স)।
সাইনোপিসিস
gt স্পষ্ট reference_file prediction_file
বর্ণনাঃ
-nuc [হ্যাঁ|না]
নিউক্লিওটাইড স্তরের মূল্যায়ন করুন (মেমরি খরচ ইনপুট ফাইলের আকারের সমানুপাতিক)
(ডিফল্ট: হ্যাঁ)
-লিটার [হ্যাঁ|না]
একটি জিন পূর্বাভাসের পরিবর্তে একটি LTR রেট্রোট্রান্সপোসন পূর্বাভাস মূল্যায়ন করুন (সমস্ত
LTR_retrotransposon উপাদানগুলিকে একটি অনির্ধারিত স্ট্র্যান্ড বলে মনে করা হয়) (ডিফল্ট:
না)
-ltrdelta [মূল্য]
LTR সীমানাগুলির জন্য ডেল্টাকে সমান হিসাবে বিবেচনা করার অনুমতি দেওয়া সেট (ডিফল্ট: 20)
-v [হ্যাঁ|না]
শব্দযুক্ত হতে (ডিফল্ট: না)
-o [ফাইলের নাম]
নির্দিষ্ট ফাইলে আউটপুট পুনঃনির্দেশিত (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)
-জিজিপ [হ্যাঁ|না]
gzip সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)
-bzip2 [হ্যাঁ|না]
bzip2 সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)
- বল [হ্যাঁ|না]
আউটপুট ফাইলে জোর করে লেখা (ডিফল্ট: না)
-হেল্প
সাহায্য প্রদর্শন এবং প্রস্থান
-version
সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন করুন এবং প্রস্থান করুন
প্রোগ্রামটি নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্যের ধরনগুলির জন্য সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতার মান দেখায় (যেমন,
জিন, এমআরএনএ এবং এক্সন)। কিছু বৈশিষ্ট্যের প্রকারের জন্য অনুপস্থিত এবং ভুল বৈশিষ্ট্যের সংখ্যা
যে ধরনের এছাড়াও দেখানো হয়. এইভাবে, "অনুপস্থিত" এর অর্থ হল যে ধরণের বৈশিষ্ট্যগুলির সংখ্যা
"ভবিষ্যদ্বাণী" থেকে সেই ধরনের একটি বৈশিষ্ট্যকে ওভারল্যাপ ছাড়াই "রেফারেন্স"। ভাইস
বিপরীতে, "ভুল" ছাড়া "ভবিষ্যদ্বাণী" থেকে সেই ধরণের বৈশিষ্ট্যের সংখ্যা বোঝায়
"রেফারেন্স" থেকে সেই ধরণের একটি বৈশিষ্ট্যে ওভারল্যাপ করুন।
প্রতিবেদনের বাগ
বাগ রিপোর্ট করুন[ইমেল সুরক্ষিত]>.
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে gt-eval অনলাইন ব্যবহার করুন