এটি হল hmm-assembler.pl কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
hmm-assembler.pl - SNAP মডিউল hmm-assembler.pl
সাইনোপিসিস
hmm-assembler.pl [-বিকল্প [-আরও বিকল্প]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
বিকল্প
সার্জারির অনুসরণ একক-অক্ষর অপশন হয় গৃহীত:
যুক্তি সহ: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
বুলিয়ান (আর্গুমেন্ট ছাড়া): -r -o -x -p -t -1
বিকল্পগুলি একসাথে একত্রিত করা যেতে পারে। -- বিকল্পগুলির প্রক্রিয়াকরণ বন্ধ করে। স্থান প্রয়োজন হয় না
বিকল্প এবং তাদের আর্গুমেন্ট মধ্যে.
বিকল্প:
-i [৫০০]
-e [৫০০]
-A [০:৩০]
-D [০:৩০]
-M [০:৩০]
-S [০:৩০]
-C [৪]
-I [৪]
-N [৪]
-3 [] 3'UTR মডেল অন্তর্ভুক্ত, প্রয়োজন -a
-a [] PolyA মডেল অন্তর্ভুক্ত, প্রয়োজন -3
-5 [] 5'UTR moel অন্তর্ভুক্ত, প্রয়োজন -p
-p জেনেরিক প্রবর্তক মডেল অন্তর্ভুক্ত, প্রয়োজন -5
-r জেনেরিক পুনরাবৃত্তি মডেল অন্তর্ভুক্ত
-o বিপরীত ORF মডেল অন্তর্ভুক্ত
-x সুস্পষ্ট সময়কাল intron মডেল ব্যবহার করুন
-t C.elegans trans-splicing অন্তর্ভুক্ত, প্রয়োজন -p, -5
-Z ক্লেড-নির্দিষ্ট মান সেট করে (কৃমি, মাছি, উদ্ভিদ)
-1 একক জিন মডেল
-c
GC-AG স্প্লাইস দাতা মডেল অন্তর্ভুক্ত করুন
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে hmm-assembler.pl ব্যবহার করুন