এটি হল ইন্ডিগো-ডেকো কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
ইন্ডিগো-ডেকো - অণু স্ক্যাফোল্ড সনাক্তকরণ এবং আর-গ্রুপ ডিকনভোলিউশন
সাইনোপিসিস
ইন্ডিগো-ডেকো নথি পত্র [পরামিতি]
ইন্ডিগো-ডেকো -h
বর্ণনাঃ
ইন্ডিগো-ডেকো পারফোমস মলিকিউল স্ক্যাফোল্ড ডিটেকশন এবং আর-গ্রুপ ডিকনভোলিউশন। গৃহীত
ফরম্যাটগুলো হল: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES এবং CML।
বিকল্প
ইন্ডিগো-ডেকো নিম্নলিখিত পরামিতি গ্রহণ করে।
-h সাহায্য বার্তা প্রিন্ট করুন
-a আনুমানিক স্ক্যাফোল্ড গণনা করুন (ডিফল্ট সঠিক)
-s
মলফাইলে সর্বাধিক পাওয়া স্ক্যাফোল্ড লিখুন
-S
SD-ফাইলে পাওয়া সমস্ত ভারা লিখুন
-l
ভারা গণনা করবেন না, কিন্তু ফাইল থেকে লোড করুন
-sr
একটি ফাইলে R-সাইট দিয়ে ভারা লিখুন
-o
ফাইলে হাইলাইট করা অণুগুলি লিখুন
-r
ফাইলে পৃথক r-গ্রুপ সহ ফলাফল অণু লিখুন
নির্মিত কোন সুগন্ধি বিবেচনা
-- বিকল্পের শেষ চিহ্নিত করে
উদাহরণ
ইন্ডিগো-ডেকো *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
বর্তমান ডিরেক্টরিতে molfiles থেকে অণু পড়ুন, সর্বাধিক পাওয়া ভারা সংরক্ষণ করুন
scaf.mol এ এবং হাইলাইট করা অণুগুলিকে hl.sdf এ সংরক্ষণ করুন।
ইন্ডিগো-ডেকো structure.mol many.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
structure.mol থেকে একটি অণু এবং many.sdf থেকে একাধিক অণু পড়ুন, সংরক্ষণ করুন
r-rgoups সহ অণুগুলি rg.sdf-এ এবং সমস্ত পাওয়া স্ক্যাফোল্ডগুলি allscafs.sdf-এ সংরক্ষণ করুন৷
ইন্ডিগো-ডেকো *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
বর্তমান ডিরেক্টরির প্রতিটি SMILES ফাইল থেকে একাধিক অণু পড়ুন, পড়ুন
readyscaf.mol থেকে স্ক্যাফোল্ড করুন এবং হাইলাইট করা অণুগুলিকে hl.sdf এ সংরক্ষণ করুন।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে ইন্ডিগো-ডেকো ব্যবহার করুন