এটি হল ipig কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
ipig - জিনোম ব্রাউজার ভিজ্যুয়ালাইজেশনের মধ্যে PSMs একীভূত করা
সাইনোপিসিস
ipig <psm ফাইল> |-g|-c|-cg [ ]
বর্ণনাঃ
iPiG ভর স্পেকট্রোমেট্রি থেকে পেপটাইড স্পেকট্রাম ম্যাচ (PSMs) এর একীকরণকে লক্ষ্য করে
জিনোম ব্রাউজার দ্বারা প্রদত্ত জিনোমিক ভিজ্যুয়ালাইজেশনে (MS) পেপটাইড সনাক্তকরণ
UCSC জিনোম ব্রাউজার হিসাবে (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG MS স্ট্যান্ডার্ড ফরম্যাট mzIdentML (*.mzid) থেকে বা টেক্সট ফরম্যাটে PSMs নেয় এবং
জিনোম ট্র্যাক ফরম্যাটে ফলাফল প্রদান করে (BED এবং GFF3 ফাইল), যা সহজেই হতে পারে
জিনোম ব্রাউজারে আমদানি করা হয়েছে।
বিকল্প
<psm ফাইল>
পেপটাইড স্পেকট্রাম মিলের সাথে ফাইলটি নির্দেশ করে (mzid/txt)
-g, -গুই
iPiG এর গ্রাফিক্যাল ইউজার ইন্টারফেস শুরু করে
-c, -নিয়ন্ত্রণ
জিন নিয়ন্ত্রণ শুরু করে, প্রয়োজনীয় ফাইলগুলি কনফিগারেশনে নির্দেশ করতে হবে
ফাইল
-cg, -নিয়ন্ত্রণ
জিন নিয়ন্ত্রণের গ্রাফিক্যাল ইউজার ইন্টারফেস শুরু করে
-d, -ডাউনলোডার
ডাউনলোড gui শুরু করে
একটি ভিন্ন কনফিগারেশন ফাইল নির্দেশ করা যেতে পারে (অন্যথায় ipig.conf দ্বারা লোড করা হয়
ডিফল্ট)
অতিরিক্ত আবশ্যক:
একটি নন-গুই মোড ব্যবহার করে, একটি কনফিগার ফাইলে (ডিফল্টরূপে ipig.conf) একাধিক ধারণ করতে হয়
অতিরিক্ত পরামিতি, যেমন রেফারেন্স জিনোম নির্দেশ করে ইত্যাদি।
একটি গুই মোডে (-g এবং -cg), অতিরিক্ত পরামিতি দুটি উপায়ে নির্দেশ করা যেতে পারে, ভিতরে
ইন্টারফেস বা একটি কনফিগার ফাইলের সাথেও।
উদাহরণ এবং সম্পর্কে আরও বিশদ বিবরণের জন্য readme.txt এবং ipig.conf দেখুন
অতিরিক্ত পরামিতি
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে ipig ব্যবহার করুন
