āĻ‡āĻ‚āĻ°ā§‡āĻœāĻŋāĻĢāĻ°āĻžāĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻŋāĻļ

Ad


āĻ…āĻ¨āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ āĻĢā§‡āĻ­āĻŋāĻ•āĻ¨

khmer - āĻ•ā§āĻ˛āĻžāĻ‰āĻĄā§‡ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨

āĻ‰āĻŦā§āĻ¨ā§āĻŸā§ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨, āĻĢā§‡āĻĄā§‹āĻ°āĻž āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨, āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ°ā§‡āĻ° āĻŽāĻžāĻ§ā§āĻ¯āĻŽā§‡ OnWorks āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡ āĻšā§‹āĻ¸ā§āĻŸāĻŋāĻ‚ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻ¤ā§‡ āĻ–āĻŽā§‡āĻ° āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨

āĻāĻŸāĻŋ āĻšāĻ˛ āĻ–āĻŽā§‡āĻ° āĻ•āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ¯āĻž āĻ†āĻŽāĻžāĻĻā§‡āĻ° āĻāĻ•āĻžāĻ§āĻŋāĻ• āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡āĻ° āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§‡āĻŽāĻ¨ āĻ‰āĻŦā§āĻ¨ā§āĻŸā§ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨, āĻĢā§‡āĻĄā§‹āĻ°āĻž āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨, āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°ā§‡ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§‹āĻ¸ā§āĻŸāĻŋāĻ‚ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻ¤ā§‡ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹ āĻ¯ā§‡āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤

āĻ•āĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻ•ā§āĻ°āĻŽ:

NAME āĻāĻ°


āĻ–ā§‡āĻŽā§‡āĻ° - āĻ•ā§‡-āĻŽā§‡āĻ° āĻ—āĻŖāĻ¨āĻž, āĻĢāĻŋāĻ˛ā§āĻŸāĻžāĻ°āĻŋāĻ‚ āĻāĻŦāĻ‚ āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻĢ āĻŸā§āĻ°āĻžāĻ­āĻžāĻ°ā§āĻ¸āĻžāĻ˛ FTW!

k-mer-āĻ­āĻŋāĻ¤ā§āĻ¤āĻŋāĻ• āĻĄā§‡āĻŸāĻžāĻ¸ā§‡āĻŸ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ āĻāĻŦāĻ‚ āĻ°ā§‚āĻĒāĻžāĻ¨ā§āĻ¤āĻ° āĻ•āĻ°āĻžāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ–āĻŽā§‡āĻ° āĻšāĻ˛ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ˛āĻžāĻ‡āĻŦā§āĻ°ā§‡āĻ°āĻŋ āĻāĻŦāĻ‚ āĻŸā§āĻ˛āĻ•āĻŋāĻŸ

āĻ¸āĻžāĻ‡āĻ¨ā§‹āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¸


āĻ–ā§‡āĻŽā§‡āĻ° [āĻŦāĻŋāĻ•āĻ˛ā§āĻĒ] args

āĻ¯ā§‡āĻŽāĻ¨āĨ¤

āĻ–ā§‡āĻŽā§‡āĻ° āĻ˛ā§‹āĻĄ-āĻ‡āĻ¨-āĻ•āĻžāĻ‰āĻ¨ā§āĻŸāĻŋāĻ‚ -x 1e8 -k 20 reads.ct reads.fa.gz

, USAGE


āĻāĻ‡ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻĒā§‡āĻœāĻŸāĻŋ āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻž āĻ•āĻ°ā§‡ āĻ–ā§‡āĻŽā§‡āĻ° āĻŽā§‹āĻĄāĻŧāĻ• āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻŸāĨ¤ āĻ¸āĻĢāĻŸāĻ“āĻ¯āĻŧā§āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻ°ā§āĻ•ā§‡ āĻœāĻžāĻ¨āĻ¤ā§‡ āĻāĻŦāĻ‚
āĻ•āĻŋāĻ­āĻžāĻŦā§‡ āĻāĻŸāĻŋ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°āĻŦā§‡āĻ¨ āĻ…āĻ¨ā§āĻ—ā§āĻ°āĻš āĻ•āĻ°ā§‡ āĻĻā§‡āĻ–ā§āĻ¨ /usr/share/doc/khmer āĻ…āĻĨāĻŦāĻž āĻ…āĻ¨ā§āĻ¯āĻĨāĻžāĻ¯āĻŧ http://khmer.readthedocs.org/.

āĻĄā§‡āĻŦāĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨/āĻ‰āĻŦā§āĻ¨ā§āĻŸā§āĻ¤ā§‡, āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻ•ā§‡āĻœ āĻ°āĻ•ā§āĻˇāĻŖāĻžāĻŦā§‡āĻ•ā§āĻˇāĻŖāĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻ°āĻž āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻŸā§‡āĻ° āĻŦāĻĄāĻŧ āĻ¸āĻ‚āĻ—ā§āĻ°āĻš āĻ•āĻ°āĻž āĻāĻĄāĻŧāĻžāĻ¯āĻŧ
āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽ PATH āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§‡. āĻŦāĻ°āĻ‚, āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻŸāĻŸāĻŋ āĻšāĻžāĻ˛ā§ āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻāĻ•āĻ• āĻŽā§‹āĻĄāĻŧāĻ• āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻŸ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧ
āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡ āĻšāĻžāĻ¨; āĻ¤āĻžāĻ‡ āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻ–ā§‡āĻŽāĻžāĻ° āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§‡āĻļāĻ¨āĻž āĻŦāĻ˛ā§‡ āĻĻā§ŒāĻĄāĻŧāĻžāĻ¤ā§‡ load-in-counting.py
...āĻ¯āĻžāĻ‡ āĻšā§‹āĻ•... āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ•ā§‡ āĻāĻ‡ āĻ•āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄā§‡āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§‡ āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻŋāĻ•ā§āĻ¸ āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡ āĻšāĻŦā§‡ āĻ–ā§‡āĻŽā§‡āĻ°. āĻ‰āĻĒāĻ°āĻ¨ā§āĻ¤ā§, .py āĻāĻ•ā§āĻ¸āĻŸā§‡āĻ¨āĻļāĻ¨
āĻŦāĻžāĻĻ āĻĻā§‡āĻ“āĻ¯āĻŧāĻž āĻšāĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡, āĻĢāĻ˛āĻ¸ā§āĻŦāĻ°ā§‚āĻĒ āĻ‰āĻĒāĻ°ā§‡ āĻĻā§‡āĻ–āĻžāĻ¨ā§‹ āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻŸā§‡āĻ° āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ•āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄāĨ¤

āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯āĻĻāĻŋ āĻāĻŸāĻŋ āĻĒāĻ›āĻ¨ā§āĻĻ āĻ¨āĻž āĻ•āĻ°ā§‡āĻ¨ āĻ¤āĻŦā§‡ āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻ•ā§āĻ¤āĻŋāĻ—āĻ¤ PATH-āĻ /usr/lib/khmer/bin āĻ¯ā§‹āĻ— āĻ•āĻ°ā§āĻ¨āĨ¤

onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§‡āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°ā§‡ āĻ–ā§‡āĻŽāĻžāĻ° āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°ā§āĻ¨


āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡ āĻ¸āĻžāĻ°ā§āĻ­āĻžāĻ° āĻāĻŦāĻ‚ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻļāĻ¨

āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻāĻŦāĻ‚ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨

āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻ•āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄāĻ—ā§āĻ˛āĻŋ

Ad