এটি হল মাইক্রো_রেজার কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
micro_razers
সাইনোপিসিস
micro_razers [বিকল্প]
বর্ণনাঃ
MicroRazerS একটি উপসর্গ-ভিত্তিক ম্যাপিং কৌশল ব্যবহার করে ছোট আরএনএ রিড সম্ভাব্যভাবে ম্যাপ করতে
3' অ্যাডাপ্টার ক্রম ধারণকারী।
(c) কপিরাইট 2009 Anne-Katrin Emde দ্বারা।
-h, --help
এই সাহায্য বার্তা প্রদর্শন করে.
--সংস্করণ
সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন করুন
প্রধান বিকল্প::
-o, --আউটপুট ফাইল
আউটপুট ফাইলের নাম পরিবর্তন করুন। ডিফল্ট: .ফলাফল.
-আরআর, -- স্বীকৃতি-হার NUM টি
পরিসরে শতাংশ স্বীকৃতি হার সেট করুন [80..100]। ডিফল্ট: 100।
-এসএল, --বীজ-দৈর্ঘ্য NUM টি
বীজ দৈর্ঘ্য পরিসীমা [10..inf]. ডিফল্ট: 16।
-এসই, --বীজ-ত্রুটি
বীজে একটি ত্রুটির জন্য অনুমতি দিন
-f, --আগামী
মানচিত্র শুধুমাত্র ফরোয়ার্ড strands পড়া.
-r, -- বিপরীত
মানচিত্র শুধুমাত্র রিভার্স স্ট্র্যান্ড পড়া।
-mN, --ম্যাচ-এন
'এন' অন্য সব অক্ষরের সাথে মেলে
-m, -- সর্বোচ্চ-হিট NUM টি
রেঞ্জে [1..inf] সেরা হিটের মাত্র NUMটি আউটপুট। ডিফল্ট: 100।
-পা, --শুদ্ধ-অস্পষ্ট
সর্বোচ্চ-হিট সেরা ম্যাচের চেয়ে বেশি সহ purge রিড
-এলএম, --কম মেমরি
রানটাইম খরচে মেমরি ব্যবহার হ্রাস
-v, -- ভারবোস
ভার্বোস মোড
-ভিভি, --ভারবোস
খুব ভার্বোস মোড
আউটপুট বিন্যাস বিকল্প::
-এর, --আউটপুট ফরমেট NUM টি
আউটপুট বিন্যাস সেট করুন। 0 = MicroRazerS ফরম্যাট, 1 = SAM। পরিসরে [0..1]।
-a, -- প্রান্তিককরণ
প্রতিটি ম্যাচের জন্য প্রান্তিককরণ ডাম্প করুন
-জিএন, --জিনোম-নামকরণ NUM টি
জিনোম কিভাবে নামকরণ করা হয় তা নির্বাচন করুন। 0 = ফাস্টা আইডি ব্যবহার করুন, 1 = গণনা করুন 1 দিয়ে শুরু করুন
পরিসীমা [0..1]। ডিফল্ট: 0।
-আরএন, --পঠন-নামকরণ NUM টি
কিভাবে পঠিত নামকরণ করা হয় নির্বাচন করুন. 0 = ফাস্টা আইডি ব্যবহার করুন, 1 = গণনা করুন 1 দিয়ে শুরু করুন
পরিসীমা [0..1]। ডিফল্ট: 0।
-তাই, --সর্ট অর্ডার NUM টি
ম্যাচগুলি কীভাবে সাজানো হয় তা নির্বাচন করুন। 0 = পঠিত সংখ্যা, 1 = জিনোম অবস্থান। সীমার মধ্যে
[০..১]। ডিফল্ট: 0।
-পিএফ, --পজিশন-ফরম্যাট NUM টি
শুরু/শেষ অবস্থান সংখ্যায়ন নির্বাচন করুন (নীচে স্থানাঙ্ক বিভাগ দেখুন)। 0 = ফাঁক স্থান,
1 = অবস্থান স্থান। পরিসরে [0..1]। ডিফল্ট: 0।
সংস্করণ
micro_razers সংস্করণ: 1.0.1 সর্বশেষ আপডেট জুলাই 2009
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে micro_razers ব্যবহার করুন