মিরাবাইত - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

মিরাবাইত - একটি পঠিত সংগ্রহ থেকে পঠন নির্বাচন করুন

সাইনোপিসিস

মিরাবাইত [-f ] [-t [-টি ...]] [-ইক্লোর] baitfile infile

বর্ণনাঃ

মিরাবাইত একটি পঠিত সংগ্রহ থেকে পাঠ নির্বাচন করে যা আংশিকভাবে একই বা সমান
ক্রম লক্ষ্য টোপ হিসাবে সংজ্ঞায়িত. সাদৃশ্য একটি ব্যবহারকারী-নিয়ন্ত্রণযোগ্য খুঁজে বের করে সংজ্ঞায়িত করা হয়
সাধারণ k-mers সংখ্যা (k পরপর বেসের ক্রম) যা টোপ একই
সিকোয়েন্স এবং স্ক্রীন করা সিকোয়েন্স নির্বাচন করতে হবে, হয় ফরোয়ার্ড অথবা রিভার্স
পরিপূরক দিক।

বিকল্প

-f
এই ধরনের প্রজেক্ট ফাইল লোড করুন, যেখানে fromtype হল:

CAF থেকে caf ক্রম

MAF থেকে maf ক্রম

পিএইচডি থেকে পিএইচডি সিকোয়েন্স

একটি GBF থেকে gbf ক্রম

একটি FASTA থেকে fasta ক্রম

একটি FASTQ থেকে fastq ক্রম

-t
এই ধরণের ক্রমগুলি লিখুন (এর একাধিক উল্লেখ -t অনুমতি দেওয়া হয়):

ফাস্টা থেকে ফাস্টা সিকোয়েন্স

FASTQ থেকে fastq ক্রম

CAF থেকে caf সিকোয়েন্স

MAF থেকে maf ক্রম

টেক্সট ফাইলে txt সিকোয়েন্সের নাম

-k কে-মের, ঘাঁটিতে টোপের দৈর্ঘ্য (<32, ডিফল্ট=31)

-n মিন. প্রয়োজনীয় কে-মের টোপ সংখ্যা (ডিফল্ট = 1)

-i ইনভার্স হিট: শুধুমাত্র এমন সিকোয়েন্স লেখে যা টোপ দেয় না

-r বিপরীত পরিপূরক দিক কোন চেকিং

-o fastq মানের অফসেট (শুধুমাত্র জন্য -f = 'fastq') FASTQ-এ মানের মানের অফসেট
ফাইল ডিফল্ট: 33 0 এর একটি মান স্বয়ংক্রিয়ভাবে সনাক্ত করার চেষ্টা করে।

-f
এই ধরনের প্রজেক্ট ফাইল লোড করুন, যেখানে fromtype হল:

CAF থেকে caf ক্রম

MAF থেকে maf ক্রম

পিএইচডি থেকে পিএইচডি সিকোয়েন্স

একটি GBF থেকে gbf ক্রম

একটি FASTA থেকে fasta ক্রম

একটি FASTQ থেকে fastq ক্রম

-t
এই ধরণের ক্রমগুলি লিখুন (এর একাধিক উল্লেখ -t অনুমতি দেওয়া হয়):

ফাস্টা থেকে ফাস্টা সিকোয়েন্স

FASTQ থেকে fastq ক্রম

CAF থেকে caf সিকোয়েন্স

MAF থেকে maf ক্রম

টেক্সট ফাইলে txt সিকোয়েন্সের নাম

-k কে-মের, ঘাঁটিতে টোপের দৈর্ঘ্য (<32, ডিফল্ট=31)

-n মিন. প্রয়োজনীয় কে-মের টোপ সংখ্যা (ডিফল্ট = 1)

-i ইনভার্স হিট: শুধুমাত্র এমন সিকোয়েন্স লেখে যা টোপ দেয় না

-r বিপরীত পরিপূরক দিক কোন চেকিং

-o fastq মানের অফসেট (শুধুমাত্র জন্য -f = 'fastq') FASTQ-এ মানের মানের অফসেট
ফাইল ডিফল্ট: 33 0 এর একটি মান স্বয়ংক্রিয়ভাবে সনাক্ত করার চেষ্টা করে।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে মিরাবাইট ব্যবহার করুন