এটি হল vcf-compare কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
vcf-তুলনা - bgzipped এবং tabix সূচীকৃত VCF ফাইলগুলির তুলনা করুন
সাইনোপিসিস
তুলনা-ভিসিএফ [বিকল্প] file1.vcf file2.vcf ...
বর্ণনাঃ
সম্পর্কে: bgzipped এবং tabix সূচীকৃত VCF ফাইলগুলির তুলনা করুন। (যেমন bgzip file.vcf; ট্যাবিক্স -p ভিসিএফ
file.vcf.gz)
বিকল্প
-c, --ক্রোমোজোম
একই রকম -r, পশ্চাদগামী সামঞ্জস্যের জন্য বাম। এটা যেমন হবে ব্যবহার করবেন না দয়া করে
ভবিষ্যতে বাদ দেওয়া হয়েছে।
-d, --ডিবাগ
ডিবাগিং তথ্য। বিকল্পটি একাধিকবার প্রদান করলে ভারবোসিটি বাড়ে
-H, --cmp-হ্যাপ্লোটাইপস
হ্যাপ্লোটাইপ তুলনা করুন, শুধুমাত্র অবস্থান নয়
-m, --নাম-ম্যাপিং
সাথে ব্যবহার করো -H বিভিন্ন কলাম নামের সাথে ফাইল তুলনা করার সময়। এর পক্ষে যুক্তি
অপশন হল একটি কমা দ্বারা পৃথক করা তালিকা বা একটি ফাইলে প্রতি লাইনে একটি ম্যাপিং। নামগুলো হলো
কোলন আলাদা করা হয়েছে এবং কমান্ড লাইনের ফাইলগুলির মতো একই ক্রমে উপস্থিত হওয়া আবশ্যক।
-R, --refseq
প্রকৃত ক্রম তুলনা করুন, শুধু অবস্থান নয়। সাথে ব্যবহার করো -w indels তুলনা.
-r, --অঞ্চল
প্রদত্ত অঞ্চলগুলি প্রক্রিয়া করুন (কমা দ্বারা পৃথক তালিকা বা একটি ফাইলে প্রতি লাইনে একটি অঞ্চল)।
-s, -- নমুনা
শুধুমাত্র তালিকাভুক্ত নমুনা প্রক্রিয়া. অবাঞ্ছিত নমুনা বাদ বাড়তে পারে
কর্মক্ষমতা যথেষ্ট।
-w, --জয়
পুনরাবৃত্তিমূলক ক্রমগুলিতে, একই ইনডেলকে বিভিন্ন অবস্থানে বলা যেতে পারে।
রেকর্ডগুলিকে একে অপরের সাথে মিল হিসাবে বিবেচনা করুন (সেটি একটি SNP বা একটি ইনডেল হোক)।
-h, -?, --help
এই সাহায্য বার্তা.
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে vcf-তুলনা ব্যবহার করুন
