এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য ChIP-RNA-seqPRO নামে একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ CloudclientID.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য ChIP-RNA-seqPRO নামের এই অ্যাপটি ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
লিনাক্সে অনলাইনে চালানোর জন্য ChIP-RNA-seqPRO
বর্ণনাঃ
চিপ-আরএনএ-সিকপ্রো: বিভ্রান্তিকর ট্রান্সক্রিপ্ট স্প্লিসিং এবং আরএনএ-সম্পাদনা সাইটগুলির সাথে যুক্ত এপিজেনেটিক ডিরেগুলেশনের অঞ্চলগুলি সনাক্ত করার জন্য একটি কৌশল। কাস্টমাইজড টীকা লাইব্রেরি, ডেমো ডেটা ইনপুট এবং README গাইডের সাথে একসাথে প্যাকেজ করা চালিত পাইথন স্ক্রিপ্ট।9/26 : v1.1 পাইথন পান্ডাদের দ্বারা নিক্ষিপ্ত ত্রুটি ডিবাগ করতে MAIN_IV আপডেট করা হয়েছে যা আর 'সাবসেট' সমর্থন করে না।
এই কোডটি এখানে আর সক্রিয়ভাবে রক্ষণাবেক্ষণ/আপডেট করা হবে না। এপিজেনেটিক, সিকোয়েন্স ভ্যারিয়েশন এবং এক্সপ্রেশন ডেটাসেটের তুলনামূলক বিশ্লেষণের জন্য একটি ক্লাউড-ভিত্তিক সংস্থান এখন উপলব্ধ। দয়া করে ক্লাউডমিক্স দেখুন, ক্লাউড-ভিত্তিক সংস্থানগুলির জন্য প্রকল্প: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
বৈশিষ্ট্য
- এপিজেনোমিক (ChIPseq, MBDseq, ইত্যাদি) এবং RNA-ভিত্তিক সিকোয়েন্সিং পেয়ারড নমুনা ডেটাসেটের একটি বিস্তৃত বৈচিত্র্যের তুলনামূলক বিশ্লেষণের জন্য টুল
- আপনি যদি এই টুল বা টীকা লাইব্রেরিগুলির কোনোটি ব্যবহার করেন তাহলে অনুগ্রহ করে নিম্নলিখিত রেফারেন্স অন্তর্ভুক্ত করুন: চ্যাম্পিয়ন এম., হ্লাডি আর., ইয়ান এইচ., ইভান্স জে., নিই জে., লি জে., বোজেনবার্গার জে., নন্দকুমার কে., ডেভিলা জে., মুর আর., নায়ার এ., ও'ব্রায়েন ডি., ঝু ওয়াই., কর্টুম কে., ওর্ডোগ টি., ঝাং জেড., জোসেফ আর., কোচার জে., জোনাশ ই., রবার্টসন কে., টিবেস R. এবং H. Ho T. (2015)। অ্যাবারেন্ট ট্রান্সক্রিপ্ট স্প্লাইসিং এবং আরএনএ-সম্পাদনার সাথে যুক্ত এপিজেনেটিক ডিরেগুলেশনের অঞ্চলগুলি সনাক্ত করার জন্য বায়োইনফরমেটিক্স কৌশল। বায়োইনফরমেটিক্স মডেল, পদ্ধতি এবং অ্যালগরিদম, পৃষ্ঠা 163-170 সংক্রান্ত আন্তর্জাতিক সম্মেলনের কার্যক্রমে। DOI: 10.5220/0005248001630170
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
প্রোগ্রামিং ভাষা
ইউনিক্স শেল, পাইথন
এটি এমন একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
