এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য EXCAVATOR-tool নামে একটি Linux অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান EXCAVATOR-tool নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
লিনাক্সে অনলাইনে চালানোর জন্য EXCAVATOR- টুল
বর্ণনাঃ
মনোযোগ!!!!!মনোযোগ!!!!!মনোযোগ!!!!!মনোযোগ!!!!!আমরা সম্প্রতি বিএমসি জিনোমিক্সে একটি অভিনব সফ্টওয়্যার প্যাকেজ প্রকাশ করেছি, যার নাম XCAVATOR, সংক্ষিপ্ত এবং দীর্ঘ পঠিত পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং পরীক্ষাগুলি থেকে CNVs/CNA সনাক্তকরণের জন্য (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR এ অবাধে উপলব্ধ http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR হল সম্পূর্ণ-এক্সোম সিকোয়েন্সিং ডেটা থেকে কপি নম্বর ভেরিয়েন্ট (CNVs) সনাক্ত করার জন্য একটি অভিনব সফ্টওয়্যার প্যাকেজ৷
EXCAVATOR জিনোম বায়োলজিতে প্রকাশিত হয়েছে (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
#######################
মনোযোগ!!!!! EXCAVATOR টুলটি সঠিকভাবে ব্যবহার করার জন্য, ব্যবহারকারীদের অবশ্যই নিম্নলিখিত লিঙ্কে অনন্য ম্যাপযোগ্যতা ফাইলগুলি ডাউনলোড করতে হবে:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (hg19 এর জন্য)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
বৈশিষ্ট্য
- নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং
- কপি নম্বর বৈকল্পিক
- পুরো এক্সোম সিকোয়েন্সিং
প্রোগ্রামিং ভাষা
পার্ল
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/excavatortool/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।