এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য kSNP নামের একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশটি kSNP3.1_Linux_package.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান kSNP নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
অনলাইনে লিনাক্সে চালানোর জন্য kSNP
Ad
বর্ণনাঃ
কেএসএনপি জিনোম সিকোয়েন্সের একটি সেটে প্যান-জিনোম এসএনপিগুলি সনাক্ত করে এবং সেই এসএনপিগুলির উপর ভিত্তি করে ফাইলোজেনেটিক গাছের অনুমান করে। এসএনপি আবিষ্কারটি কে-মের বিশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে এবং এর জন্য একাধিক ক্রম সারিবদ্ধকরণ বা একটি রেফারেন্স জিনোম নির্বাচনের প্রয়োজন নেই, তাই kSNP ইনপুট হিসাবে 100 এর মাইক্রোবিয়াল জিনোম নিতে পারে। একটি SNP লোকাস একটি কেন্দ্রীয় SNP অ্যালিলের চারপাশে অবস্থিত k দৈর্ঘ্যের অলিগো দ্বারা সংজ্ঞায়িত করা হয়। kSNP সম্পূর্ণ (সমাপ্ত) জিনোম এবং অসমাপ্ত জিনোম উভয়কেই একত্রিত কন্টিগ বা কাঁচা, আনসেম্বলড রিডগুলিতে বিশ্লেষণ করতে পারে। সমাপ্ত এবং অসমাপ্ত জিনোমগুলি একসাথে বিশ্লেষণ করা যেতে পারে, এবং kSNP স্বয়ংক্রিয়ভাবে সমাপ্ত জিনোমের Genbank ফাইলগুলি ডাউনলোড করতে পারে এবং সেই ফাইলগুলির তথ্যগুলিকে SNP টীকাতে অন্তর্ভুক্ত করতে পারে।গার্ডনার, এসএন এবং হল, বিজি 2013। যখন পুরো-জিনোম সারিবদ্ধকরণ কাজ করবে না: শত শত মাইক্রোবায়াল জিনোমের প্রান্তিককরণ-মুক্ত SNP আবিষ্কার এবং ফাইলোজেনেটিক্সের জন্য kSNP v2 সফ্টওয়্যার। PLOS ONE, 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/ksnp/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
