এটি MIPGen নামের একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি mipgen_v15.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
MIPGen নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks সহ অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
এমআইপিজেন
বর্ণনাঃ
আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্ভাব্য জেনারেটর
MIPGEN হল একটি পাইথন প্রোগ্রাম যা আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্ভাব্য গ্রিড গণনা করবে
একটি প্রদত্ত অণুর উপর, এটি একটি প্রোটিন বা একটি ছোট জৈব যৌগ (ঔষধ) হতে পারে।
আউটপুট DX বিন্যাস (*.dx) সহ গ্রিডের একটি সিরিজ হবে যা ব্যবহারকারী সক্ষম হবে
VMD, PyMol, Chimera এর মত যেকোন আণবিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন প্রোগ্রাম ব্যবহার করে কল্পনা করতে...
নির্ভরতা এবং ব্যবহার সম্পর্কে আরও তথ্যের জন্য, অনুগ্রহ করে ডকুমেন্টেশন পড়ুন।
ব্যবহারকারীরা বাগ এবং অনুরোধ মেনুতে যেকোনো বাগ বা অনুরোধ পোস্ট করতে স্বাগত জানাই। (sourceforge অ্যাকাউন্ট প্রয়োজন হবে)।
বৈশিষ্ট্য
- সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় MIP জেনারেশন একটি সাধারণ PDB ফাইল দেওয়া হয়েছে।
- ওপেন সোর্স কোড। ব্যবহারকারীরা প্রোব বাড়ানো বা কোড উন্নত করতে অবদান রাখতে স্বাগত জানাই।
- পেপটাইড এবং অন্যান্য ম্যাক্রোমলিকুলার সিস্টেমের উপর গ্রিড ভিত্তিক আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্ভাব্যতা গণনা করুন (সম্ভবত এখনও বড় সিস্টেমের জন্য ধীর)
- ছোট অণুর উপর MIP গণনা করুন
- কাস্টমাইজযোগ্য প্রোব. ইতিমধ্যেই বাস্তবায়িত হয়েছে: হাইড্রোফোবিক, এইচ-বন্ড দাতা, এইচ-বন্ড গ্রহণকারী এবং ইলেক্ট্রোস্ট্যাটিক্স প্রোব।
- AmbertTools প্যাকেজ থেকে ওপেনসোর্স Antechamber এবং tLeap-এর সাথে ইন্টারফেস করে ছোট অণু এবং প্রোটিনগুলিতে পরমাণুর প্রকারের স্বয়ংক্রিয় নিয়োগ (http://ambermd.org)
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা, উন্নত শেষ ব্যবহারকারী, বিকাশকারী, শেষ ব্যবহারকারী/ডেস্কটপ
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কনসোল/টার্মিনাল
প্রোগ্রামিং ভাষা
পাইথন
ডাটাবেস পরিবেশ
SQLite
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/mipgen/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।