এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য ViralFusionSeq [VFS] নামের Linux অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ vfs-2016-08-17.r2.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
অনলাইনে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য ViralFusionSeq [VFS] নামের এই অ্যাপটি ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
ViralFusionSeq [VFS] লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য
বর্ণনাঃ
ভিএফএস সম্পূর্ণরূপে উবুন্টু/ডেবিয়ান সিস্টেমের অধীনে পরীক্ষা করা হয়েছিল।** ঘোষণা 1**: VFS ভাইরাস-ক্লিপের চেয়ে উচ্চতর। https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download
2016 সাল পর্যন্ত, VFS হল একমাত্র ভাইরাল ইন্টিগ্রেশন টুল যা NIH HPC সিস্টেমে উপলব্ধ।
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/
ViralFusionSeq (VFS) হল একটি বহুমুখী হাই-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং (HTS) টুল যা ভাইরাল ইন্টিগ্রেশন ইভেন্টগুলি আবিষ্কার করতে এবং একক-বেস রেজোলিউশনে ফিউশন প্রতিলিপি পুনর্গঠন করে।
ভাইরাল-মানব ফিউশন ইভেন্টগুলি আবিষ্কার এবং টীকা করতে ভিএফএস নরম-ক্লিপিং তথ্য, পঠন-জোড়া বিশ্লেষণ এবং লক্ষ্যযুক্ত ডি নভো সমাবেশকে একত্রিত করে।
ফিউশন ব্রেকপয়েন্টের গুণমান মূল্যায়নের জন্য একটি সহজ কিন্তু কার্যকর পরীক্ষামূলক পরিসংখ্যান মডেল ব্যবহার করা হয়।
ন্যূনতম ব্যবহারকারী সংজ্ঞায়িত পরামিতি প্রয়োজন.
ভিএফএস-এর ব্যবহারকারীর ম্যানুয়াল এবং ইনস্টলেশন গাইড সহ সোর্স কোড সোর্সফোর্জের "ফাইলস" বিভাগে উপলব্ধ।
উদ্ধৃতি: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
বৈশিষ্ট্য
- RNA-Seq এবং DNA-Seq ডেটা ব্যবহার করে প্রযোজ্য এবং সম্পূর্ণভাবে পরীক্ষিত
- ভাইরাল ইন্টিগ্রেশন আবিষ্কার করতে ক্লিপড-সিকোয়েন্স (CS) এবং পেয়ারড-এন্ড (RP) তথ্য উভয়ই ব্যবহার করুন
- CS এবং RP তথ্য ব্যবহার করে ফিউশন ট্রান্সক্রিপ্ট সিকোয়েন্সের পুনঃনির্মাণ
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
প্রোগ্রামিং ভাষা
পার্ল
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।