Dies ist der Befehl arden-filter, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
arden-filter – Filtern Sie eine SAM-Datei basierend auf der Analyse mit ARDEN
ZUSAMMENFASSUNG
Arden-Filter [SPEISUNG SAM] [AUSGABEDATEI] [OPTIONAL] ...
BESCHREIBUNG
Skript zum Filtern und eine SAM-Datei basierend auf der Analyse mit ARDEN. Es ist nötig zu
Geben Sie die gewünschten Grenzwerte für RQS, GAPS und MM an. Typ: Python-Filter -e 1 zum Ausdrucken
einige Beispiele.
OPTIONAL
Erforderliche Argumente:
AUSGABEDATEI
Name der Ausgabedatei
SPEISUNG Einzelne SAM-Datei zum Filtern.
--Version
Versionsnummer des Programms anzeigen und beenden
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
-r RQS, --rqs=RQS
Schwellenwert für den minimalen Lesequalitätswert. [Standard: 0]
-m Millimeter, --mismatches=MM
Schwellenwert für die maximale Anzahl von Nichtübereinstimmungen in einem Alignment [Standard: 3]
-g LÜCKEN, --Lücken=LÜCKEN
Schwellenwert für die maximale Anzahl von Lücken in einer Ausrichtung. [Standard: 3]
-e BEISPIELE, --Beispiele=BEISPIELE
Setzen Sie den Wert auf 1, wenn Sie Beispiele drucken möchten
Nutzen Sie arden-filter online über die Dienste von onworks.net
