Dies ist der Befehl bp_mrtransp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
bp_mrtrans – implementiert einen Transformator von Alignments von Protein- zu mrna-Koordinaten
ZUSAMMENFASSUNG
Verwendung:
bp_mrtrans -i Eingabedatei -o Ausgabedatei [-if Eingabeformat] [-of Ausgabeformat] [-s cDNA
Sequenzdatenbank] [-sf cDNA-Sequenzformat] [-h]
BESCHREIBUNG
Dieses Skript wandelt ein Protein-Alignment zurück in eine cDNA um. Frei nach Bill
Pearsons Mrtrans.
Die Optionen sind:
-o Dateiname - der Ausgabedateiname [Standard STDOUT]
-of format – Format der Ausgabesequenz
(Mehrfachsequenzausrichtung)
[Standard-Phylip]
-i Dateiname – der Eingabedateiname [erforderlich]
-if format – Format der Eingabesequenz
(Mehrfachsequenzausrichtung)
[Standardcluster]
-s --seqdb Dateiname – die cDNA-Sequenzdatenbankdatei
-sf --seqformat – das cDNA seq db-Format (Flatfile-Sequenzformat)
-h - dieses Hilfemenü
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