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PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

Film – Korrigieren Sie verschachtelte Bewegungen mithilfe der inversen Interpolation

ZUSAMMENFASSUNG

Film Eingabebild Ausgabebild

BESCHREIBUNG

Dieses Tool teilt ein verschachteltes Eingabebild in die Passbilder auf, registriert sie gemeinsam und
rekonstruiert ein bewegungskorrigiertes Bild

OPTIONAL

Global Toolkit Optionen (diese sind von Locals geführtes by alle CMTK Werkzeuge)
--help
Schreiben Sie eine Liste der grundlegenden Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

--Hilf allen
Schreiben Sie eine vollständige Liste der grundlegenden und erweiterten Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

- Wiki
Schreiben Sie eine Liste der Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe im MediaWiki-Markup.

--Mann
Schreiben Sie die Manpage-Quelle im 'nroff'-Markup in die Standardausgabe.

--xml
Schreiben Sie die Befehlszeilen-Syntaxspezifikation in XML-Markup (für die Slicer-Integration).

--Version
Schreiben Sie die Toolkit-Version in die Standardausgabe.

--Echo
Schreiben Sie die aktuelle Befehlszeile in die Standardausgabe.

--verbose-level
Ausführlichkeitsstufe festlegen.

- ausführlich, -v
Erhöhen Sie die Ausführlichkeitsstufe um 1 (veraltet; aus Gründen der Abwärtskompatibilität unterstützt).

--fäden
Legen Sie die maximale Anzahl paralleler Threads fest (für POSIX-Threads und OpenMP).

zufuhr Optionen
--padding-value
Legen Sie den Füllwert für das Eingabebild fest. Pixel mit diesem Wert werden ignoriert. [Standard:
Behinderte]

Interleaving Optionen
--interleave-axis
Definieren Sie die Interleave-Achse: Dies ist die Richtung der Erfassung durch das Slice.
Unterstützte Werte: „guess-from-input“, „axial“, „sagittal“, „coronal“, „interleave-x“,
„interleave-y“, „interleave-z“, wobei die Standardeinstellung „guess-from-input“ ist, oder verwenden Sie eine solche
der folgenden:

--guess-from-input
Erraten Sie anhand des Eingabebilds [Dies is Ursprünglich]

--axial, -a
Verschachtelte axiale Bilder

--sagittal, -s
Verschachtelte sagittale Bilder

--koronale, -c
Verschachtelte koronale Bilder

--interleave-x, -x
Entlang der x-Achse verschachtelt

--interleave-y, -y
Entlang der Y-Achse verschachtelt

--interleave-z, -z
Entlang der Z-Achse verschachtelt

--geht vorbei , -p
Anzahl der verschachtelten Durchläufe [Standard: 2]

--Passgewicht , -W
Legen Sie das Beitragsgewicht für einen Pass in der Form 'Pass:Gewicht' fest

Bewegung Korrektur / Registrierung: Optionen
--Referenzbild , -R
Verwenden Sie für die Registrierung ein separates hochauflösendes Referenzbild [Standard: KEINER]

--registrierungsmetrik
Registrierungsmetrik zur Bewegungsschätzung durch Bild-zu-Bild-Registrierung. Unterstützt
Werte: „nmi“, „mi“, „cr“, „msd“, „cc“, wobei der Standardwert „msd“ ist, oder verwenden Sie einen der beiden
wie folgt vor:

--nmi
Verwenden Sie normalisierte gegenseitige Informationen für die Pass-to-Reference-Registrierung

- mi Verwenden Sie für die Pass-to-Reference-Registrierung standardmäßige gegenseitige Informationen

--cr Verwenden Sie das Korrelationsverhältnis für die Pass-zu-Referenz-Registrierung

--msd
Verwenden Sie mittlere quadratische Differenzen für die Pass-zu-Referenz-Registrierung [Dies is
Ursprünglich]

--cc Verwenden Sie die Kreuzkorrelation für die Pass-to-Reference-Registrierung

--import-xforms-path
Pfad der Datei, aus der Transformationen zwischen Durchgängen importiert werden sollen. [Standard: KEINER]

--export-xforms-path
Pfad der Datei, in die Transformationen zwischen Durchgängen exportiert werden sollen. [Standard: KEINER]

Initiale Volume Spritze Optionen
--injection-kernel-sigma , -S
Standardabweichung des Gaußschen Kernels für die Volumeninjektion in Vielfachen der Pixelgröße
in jede Richtung. [Standard: 0.5]

--injection-kernel-radius , -r
Trunkierungsradiusfaktor des Injektionskernels. Der Kernel wird abgeschnitten bei
sigma*radius, wobei sigma die Kernel-Standardabweichung ist. [Standard: 2]

umkehren Interpolation Optionen
--inverse-interpolation-kernel
Kernel für die inverse Interpolationsrekonstruktion Unterstützte Werte: "cubic",
"linear", "hamming-sinc", "cosine-sinc", wobei der Standardwert "cubic" ist, oder verwenden Sie einen von
die folgende:

--kubisch, -C
Trikubische Interpolation [Dies is Ursprünglich]

--linear, -L
Trilineare Interpolation (schneller, aber weniger genau)

--hamming-sinc, -H
Sinc-Interpolation mit Hamming-Fenster

--cosinus-sinc, -O
Kosinusfenster-SiNC-Interpolation (am genauesten, aber am langsamsten)

--Fehler vierter Ordnung, -f
Verwenden Sie Fehler vierter Ordnung (anstatt zweiter Ordnung) zur Optimierung.

--num-iterationen , -n
Maximale Anzahl von inversen Interpolationsiterationen [Standard: 20]

Wiederaufbau Regulierung Optionen
--l-norm-gewicht
Beschränkungsgewichtung für L-Norm-Regularisierung vom Typ Tikhonov festlegen (0 deaktiviert Beschränkung)
[Standard: 0]

--keine Trunkierung, -T
Deaktivieren Sie die Kürzung der regionalen Intensität

Output Optionen
--write-injected-image
Schreiben Sie das Bild der anfänglichen Volumeninjektion in den Pfad [Standard: KEINER]

--write-images-as-float, -F
Ausgabebilder als Gleitkomma schreiben [Standard: wie Eingabe]

AUTOREN

Torsten Rohlfing, mit Beiträgen von Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakow und Yaroslav Halchenko

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