Dies ist der Befehlskomplex, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Komplex - Finden Sie die linguistische Komplexität in Nukleotidsequenzen
ZUSAMMENFASSUNG
Komplex -Reihenfolge Fortsetzung -lwin ganze Zahl -Schritt ganze Zahl -jmin ganze Zahl -jmax ganze Zahl
-Omnia Umschalten -sim ganze Zahl -Frequenz boolean -drucken boolean -outfile Outfile
-ujtablefile Outfile -seq Folge
Komplex -Hilfe
BESCHREIBUNG
Komplex ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Nucleic:Composition".
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Reihenfolge Fortsetzung
-lwin ganze Zahl
Standardwert: 100
-Schritt ganze Zahl
Verschiebung des Fensters über die Sequenz Standardwert: 5
-jmin ganze Zahl
Standardwert: 4
-jmax ganze Zahl
Standardwert: 6
Fortgeschrittener Abschnitt
-Omnia Umschalten
Über eine Reihe von Folgen berechnen Standardwert: N
-sim ganze Zahl
Berechnen Sie die sprachliche Komplexität durch Vergleich mit einer Reihe von Simulationen mit
eine gleichmäßige Basenverteilung
-Frequenz boolean
Führen Sie die Simulation einer Sequenz basierend auf der Grundfrequenz des Originals aus
Sequenz Standardwert: N
Output Abschnitt
-drucken boolean
Generieren Sie eine Datei mit dem Namen UjTable, die die Werte von Uj für jedes Wort j im realen enthält
Sequenz(en) und in beliebigen simulierten Sequenzen Standardwert: N
-outfile Outfile
-ujtablefile Outfile
Standardwert: complex.ujtable
-seq Folge
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