gamgi – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

Gamgi – allgemeine grafische Benutzeroberfläche für die atomistische Modellierung

ZUSAMMENFASSUNG

Gamgi [file_1.xml] ... [file_n.xml]

BESCHREIBUNG

Gamgi ist ein Computerpaket zum Konstruieren, Betrachten und Analysieren atomarer Strukturen.

OPTIONAL

file_n.xml ist ein vollständiger Name wie:

../dat/molecule/flavors/garlic.xml
~/gamgi/dat/molecule/flavors/garlic.xml
http://www.gamgi.org/dat/molecule/flavors/garlic.xml
ftp://ftp.gamgi.org/gamgi/dat/molecule/flavors/garlic.xml

Objekt- und Konfigurationsdaten können also gemischt werden file_1.xml Möglicherweise handelt es sich um eine geladene Einstellungsdatei
vor den anderen Objektdateien. Um den Vorgang zu automatisieren, fügen Sie einfach eine Zeile wie diese hinzu
~ / .bashrc:

alias gamgi='gamgi ~/gamgi/my_defaults.xml'

GAMGI_HELP
Legen Sie diese Variable fest, um GAMGI mitzuteilen, wo sich die Hilfedokumentationsdateien befinden. Für
Fügen Sie beispielsweise eine Zeile wie diese hinzu ~ / .bashrc :

GAMGI_HELP=~/gamgi/gamgi/doc; exportieren GAMGI_HELP

GAMGI_TEXT
Legen Sie diese Variable fest, um GAMGI mitzuteilen, wo sich die zu rendernden .ttf-DejaVu-Dateien befinden
solide Schriftarten. Fügen Sie beispielsweise eine Zeile wie diese hinzu ~ / .bashrc:

GAMGI_TEXT=~/gamgi/gamgi/src/io/fonts; exportieren GAMGI_TEXT

BROWSER
Legen Sie diese Variable fest, um GAMGI mitzuteilen, welcher Browser gestartet werden soll, falls dieser ausgewählt wird
um die Hilfe zu lesen. Fügen Sie beispielsweise eine Zeile wie diese hinzu ~ / .bashrc:

BROWSER=Firefox; exportieren BROWSER

HILFE

Lesen Sie Einführungsinformationen mit Hilfe->Start. Durchsuchen Sie die Dokumentation unter
http://www.gamgi.org/ oder seine lokale Kopie unter gamgi/doc/. Nutzen Sie die Hilfsmechanismen vereint
unter der Schaltfläche „Hilfe“. Abonnieren Sie die Mailingliste[E-Mail geschützt] >.

Kontaktieren Sie den Autor unter[E-Mail geschützt] >.

Bei allen Schnittstellen und Formaten werden Längen in Angström und Winkel in Grad angegeben
Dezimalzahlen werden durch Punkte dargestellt. Jeder Parameter, der in einer definiert werden kann
Schnittstelle kann auch in einer Datei definiert werden und umgekehrt.

SCHNITTSTELLEN

Drehen, verschieben und skalieren Sie das ausgewählte Objekt mit der linken, mittleren und rechten Maustaste.
Exportieren Sie das ausgewählte Objekt, indem Sie Datei->Exportieren wählen. Die Statusleiste zeigt das ausgewählte Objekt
(links) und Ebene (rechts).

Um ein Objekt auszuwählen, wählen Sie „Objekt“ -> „Auswählen“ und drücken Sie auf das Objekt. Oder wählen Sie das Objekt aus
Wählen Sie im Menü oben mit der mittleren Taste eine Klasse aus, bevor Sie auf das Objekt klicken. Oder drücken Sie
zweimal Ebene, Fenster oder GAMGI im Menü oben. Wenn das Objekt kein visuelles Element hat
Um eine Darstellung anzuzeigen, drücken Sie die Maus über den Grafikbereich, um ein Menü aufzurufen.

Um eine Ebene auszuwählen, wählen Sie „Ebene->Auswählen“ und drücken Sie die Maus über den Grafikbereich, um ihn einzublenden
ein Menü erstellen. Oder wählen Sie zuvor im Menü oben mit der mittleren Taste die Ebenenklasse aus
Drücken Sie die Maus über den Grafikbereich, um ein Menü aufzurufen.

Für feste Objekte ist in der Regel eine Beleuchtung mit diffusen und spiegelnden Komponenten erforderlich
im 3D-Raum dargestellt, sonst sehen sie flach aus. Verdrahtete Objekte haben kein 3D
Darstellung, sodass diffuses und spiegelndes Licht nicht reflektiert wird und schlecht sichtbar ist
bei der Verwendung von Licht, es sei denn, es wird eine wesentliche Umgebungskomponente verwendet. Oft lohnt es sich
Zeichnen Sie feste und verkabelte Objekte in verschiedenen Ebenen, mit und ohne Lichter.

Wenn ein Aufgabendialog geöffnet ist, wählen Sie einfach „Hilfe“ > „Aktuell“ und dann „Weiter“ aus, um zu erfahren, wie er funktioniert
Es öffnet sich ein Dialog, der die Bedeutung aller Parameter im Aufgabendialog erklärt.

Ausführliche Erläuterungen zu GAMGI-Schnittstellen finden Sie im Referenzhandbuch unter
http://www.gamgi.org/interfaces/reference.html, doc/interfaces/reference.html or
Hilfe->Thema->Schnittstellen.

FORMATEN

GAMGI kann Dateien importieren .xyz und . Xml natives Format, das von der Datei automatisch ausgewählt wird
Verlängerung. GAMGI kann Dateien exportieren .ps, .ppm, .jp[e]g, . Png, .tif[f], .x3d Und gebürtig
. Xml Formate, die automatisch durch die Dateierweiterung ausgewählt werden.

Im nativen XML-Format von GAMGI kann ein Wassermolekül wie folgt beschrieben werden:












Ausführliche Erläuterungen zu GAMGI-Formaten finden Sie im Referenzhandbuch unter
http://www.gamgi.org/formats/reference.html, doc/formats/reference.html or
Hilfe->Thema->Formate.

Beispiele:

Wählen Sie „Hilfe“ > „Tutorials“, um eine Liste der vollständig beschriebenen Verfahren zu erhalten, die die meisten Beispiele darstellen
Aspekte der Arbeit mit GAMGI.

Nutzen Sie Gamgi online über die Dienste von onworks.net